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2019

Venezuela's humanitarian crisis, resurgence of vector-borne diseases, and implications for spillover in the region

Grillet, M. E., Hernández-Villena, J. V., Llewellyn, M. S., Paniz-Mondolfi, A. E., Tami, A., Vincenti-Gonzalez, M. F., Marquez, M., Mogollon-Mendoza, A. C., Hernandez-Pereira, C. E., Plaza-Morr, J. D., Blohm, G., Grijalva, M. J., Costales, J. A., Ferguson, H. M., Schwabl, P., Hernandez-Castro, L. E., Lamberton, P. H. L., Streicker, D. G., Haydon, D. T., Miles, M. A. y 28 otros, Acosta-Serrano, A., Acquattela, H., Basañez, M. G., Benaim, G., Colmenares, L. A., Conn, J. E., Espinoza, R., Freilij, H., Graterol-Gil, M. C., Hotez, P. J., Kato, H., Lednicky, J. A., Martinez, C. E., Mas-Coma, S., Morris, J. G., Navarro, J. C., Ramirez, J. L., Rodriguez, M., Urbina, J. A., Villegas, L., Segovia, M. J., Carrasco, H. J., Crainey, J. L., Luz, S. L. B., Moreno, J. D., Noya Gonzalez, O. O., Ramírez, J. D. & Alarcón-de Noya, B., feb 21 2019, En : The Lancet Infectious Diseases.

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2018
3 Citas (Scopus)

Evaluation of the analytical and diagnostic performance of a digital droplet polymerase chain reaction (ddPCR) assay to detect Trypanosoma cruzi DNA in blood samples

Ramírez, J. D., Herrera, G., Hernández, C., Cruz-Saavedra, L., Muñoz, M., Flórez, C. & Butcher, R., dic 1 2018, En : PLoS Neglected Tropical Diseases. 12, 12, e0007063.

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Acceso abierto
2016
7 Citas (Scopus)

Host and Toxoplasma gondii genetic and non-genetic factors influencing the development of ocular toxoplasmosis: A systematic review

Fernández, C., Jaimes, J., Ortiz, M. C. & Ramírez, J. D., oct 1 2016, En : Infection, Genetics and Evolution. p. 199-209 11 p.

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Ocular Toxoplasmosis
toxoplasmosis
Toxoplasma
systematic review
Toxoplasma gondii
2019
1 Cita (Scopus)

Development of a Digital Droplet Polymerase Chain Reaction (ddPCR) assay to detect Leishmania DNA in samples from Cutaneous Leishmaniasis patients

Ramírez, J. D., Herrera, G., Muskus, C., Mendez, C., Duque, M. C. & Butcher, R., feb 1 2019, En : International Journal of Infectious Diseases. 79, p. 1-3 3 p.

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Acceso abierto
2016
6 Citas (Scopus)

Importation of hybrid human-associated Trypanosoma cruzi strains of southern South American origin, Colombia

Messenger, L. A., Ramirez, J. D., Llewellyn, M. S., Guhl, F. & Miles, M. A., ago 1 2016, En : Emerging Infectious Diseases. p. 1452-1455 4 p.

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Colombia
Trypanosoma cruzi
Chagas Disease
Centers for Disease Control and Prevention (U.S.)
Infection
85 Citas (Scopus)

Host-Protozoan Interactions Protect from Mucosal Infections through Activation of the Inflammasome

Chudnovskiy, A., Mortha, A., Kana, V., Kennard, A., Ramirez, J. D., Rahman, A., Remark, R., Mogno, I., Ng, R., Gnjatic, S., Amir, E. A. D., Solovyov, A., Greenbaum, B., Clemente, J., Faith, J., Belkaid, Y., Grigg, M. E. & Merad, M., oct 6 2016, En : Cell. p. 444-456.e14 13 p.

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Inflammasomes
Interleukin-18
Microbiota
Tritrichomonas
Chemical activation
13 Citas (Scopus)

High-Resolution Molecular Typing of Trypanosoma cruzi in 2 Large Outbreaks of Acute Chagas Disease in Colombia

Hernández, C., Vera, M. J., Cucunubá, Z., Flórez, C., Cantillo, O., Buitrago, L. S., González, M. S., Ardila, S., Dueñas, L. Z., Tovar, R., Forero, L. F. & Ramírez, J. D., oct 15 2016, En : Journal of Infectious Diseases. 214, 8, p. 1252-1255 3 p.

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Acceso abierto
Molecular Typing
Colombia
Chagas Disease
Trypanosoma cruzi
Acute Disease
2017
2 Citas (Scopus)

Molecular and morphological characterization of Acanthamoeba isolated from corneal scrapes and contact lens wearers in Argentina

Casero, R. D., Mongi, F., Laconte, L., Rivero, F., Sastre, D., Teherán, A., Herrera, G. & Ramírez, J. D., oct 1 2017, En : Infection, Genetics and Evolution. 54, p. 170-175 6 p.

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Acanthamoeba
Contact Lenses
Argentina
Lens
genotype
2019

Dissecting the Heterogeneous Population Genetic Structure of Candida albicans: Limitations and constraints of the multilocus sequence typing scheme

Muñoz, C. M., Wintaco Martinez, L. M., Muñoz, S. & Ramirez Gonzalez, J. D., may 10 2019, En : Frontiers in Microbiology. 10, 1052, p. 1-16 16 p., 1052.

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Acceso abierto
2017
10 Citas (Scopus)

Evaluation of a Multilocus Sequence Typing (MLST) scheme for Leishmania (Viannia) braziliensis and Leishmania (Viannia) panamensis in Colombia

Ramirez Gonzalez, J. D., Herrera, G., Hernández, C., Ayala, M., Flórez, C. & Teherán, A., 2017, En : Preventive Veterinary Medicine. 10, 236, p. 1 - 10 10 p.

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Acceso abierto
Leishmania guyanensis
Leishmania braziliensis
Multilocus Sequence Typing
Colombia
Leishmania
2016
4 Citas (Scopus)

Chlamydia trachomatis Frequency in a Cohort of HPV-Infected Colombian Women

Quinónez-Calvache, E. M., Ríos-Chaparro, D. I., Ramírez, J. D., Soto-De León, S. C., Camargo, M., Del Río-Ospina, L., Sánchez, R., Patarroyo, M. E. & Patarroyo, M. A., ene 25 2016, En : PLoS One. 11, 1, p. e0147504

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Chlamydia trachomatis
Polymerase chain reaction
Bacteria
Chlamydia Infections
Epidemiology
2019

Integrated genomic epidemiology and phenotypic profiling of Clostridium difficile across intra-hospital and community populations in Colombia

Muñoz, M., Restrepo-Montoya, D., Kumar, N., Iraola, G., Camargo, M., Díaz-Arévalo, D., Roa-Molina, N. S., Tellez, M. A., Herrera, G., Ríos-Chaparro, D. I., Birchenall, C., Pinilla, D., Pardo-Oviedo, J. M., Rodríguez-Leguizamón, G., Josa, D. F., Lawley, T. D., Patarroyo, M. A. & Ramírez, J. D., ago 5 2019, En : Scientific Reports. 9, 1, 11293.

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Acceso abierto
2017
3 Citas (Scopus)

Purification of Trypanosoma cruzi metacyclic trypomastigotes by ion exchange chromatography in sepharose-DEAE, a novel methodology for host-pathogen interaction studies

Cruz-Saavedra, L., Muñoz, M., León, C., Patarroyo, M. A., Arevalo, G., Pavia, P., Vallejo, G., Carranza, J. C. & Ramírez, J. D., sep 1 2017, En : Journal of Microbiological Methods. 142, p. 27-32 6 p.

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Acceso abierto
Host-Pathogen Interactions
Trypanosoma cruzi
Ion Exchange Chromatography
Sepharose
Liver
2016
36 Citas (Scopus)

Taxonomy, diversity, temporal and geographical distribution of Cutaneous Leishmaniasis in Colombia: A retrospective study

Ramírez, J. D., Hernández, C., León, C. M., Ayala, M. S., Flórez, C. & González, C., jun 22 2016, En : Scientific Reports.

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Cutaneous Leishmaniasis
Colombia
Leishmania
Retrospective Studies
Public Health Surveillance
2019
14 Citas (Scopus)

Resurgence of Vaccine-Preventable Diseases in Venezuela as a Regional Public Health Threat in the Americas

Paniz-Mondolfi, A. E., Tami, A., Grillet, M. E., Márquez, M., Hernández-Villena, J., Escalona-Rodríguez, M. A., Blohm, G. M., Mejías, I., Urbina-Medina, H., Rísquez, A., Castro, J., Carvajal, A., Walter, C., López, M. G., Schwabl, P., Hernández-Castro, L., Miles, M. A., Hotez, P. J., Lednicky, J., Morris, J. G. y 8 otros, Crainey, J., Luz, S., Ramírez, J. D., Sordillo, E., Llewellyn, M., Canache, M., Araque, M. & Oletta, J., abr 2019, En : Emerging Infectious Diseases. 25, 4, p. 625-632 8 p.

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2018
4 Citas (Scopus)

Description of Leishmania species among dogs and humans in Colombian Visceral Leishmaniasis outbreaks

Herrera, G., Higuera, A., Patiño, L. H., Ayala, M. S. & Ramírez, J. D., oct 1 2018, En : Infection, Genetics and Evolution. 64, p. 135-138 4 p.

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1 Cita (Scopus)

A systematic review of the Trypanosoma cruzi genetic heterogeneity, host immune response and genetic factors as plausible drivers of chronic chagasic cardiomyopathy

Jiménez, P., Jaimes, J., Poveda, C. & Ramírez, J. D., sep 13 2018, En : Parasitology. p. 1-15 15 p.

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2017
11 Citas (Scopus)

RNA-seq in kinetoplastids: A powerful tool for the understanding of the biology and host-pathogen interactions

Patino, L. H. & Ramírez, J. D., abr 1 2017, En : Infection, Genetics and Evolution. p. 273-282 10 p.

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host-pathogen interaction
Host-Pathogen Interactions
host-pathogen relationships
RNA
parasite
2018
1 Cita (Scopus)

Identification of bat trypanosomes from Minas Gerais state, Brazil, based on 18S rDNA and Cathepsin-L-like targets

Bento, E. C., Gómez-Hernández, C., Batista, L. R., Anversa, L., Pedrosa, A. L., Lages-Silva, E., Ramírez, J. D. & Ramirez, L. E., mar 1 2018, En : Parasitology Research. 117, 3, p. 737-746 10 p.

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2016
12 Citas (Scopus)

Untangling the transmission dynamics of primary and secondary vectors of Trypanosoma cruzi in Colombia: Parasite infection, feeding sources and discrete typing units

Hernández, C., Salazar, C., Brochero, H., Teherán, A., Buitrago, L. S., Vera, M., Soto, H., Florez-Rivadeneira, Z., Ardila, S., Parra-Henao, G. & Ramírez, J. D., ene 12 2016, En : Parasites and Vectors.

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Parasitic Diseases
Colombia
Trypanosoma cruzi
Insects
Opossums
2018
1 Cita (Scopus)

Analytical performance of a loop-mediated isothermal amplification assay for leishmania DNA detection in sandflies and direct smears of patients with cutaneous leishmaniasis

León, C. M., Muñoz, M., Tabares, J. H., Hernandez, C., Florez, C., Ayala, M. S. & Ramírez, J. D., ene 1 2018, En : American Journal of Tropical Medicine and Hygiene. 98, 5, p. 1325-1331 7 p.

Resultado de la investigación: Contribución a una revistaArtículo

The effect of temperature increase on the development of Rhodnius prolixus and the course of Trypanosoma cruzi metacyclogenesis

Tamayo, L. D., Guhl, F., Vallejo, G. A. & Ramírez, J. D., ago 2018, En : PLoS Neglected Tropical Diseases. 12, 8, p. e0006735

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1 Cita (Scopus)

The Colombian peace deal and its impact on the evolution of tropical diseases agents

Higuera, A. & Ramírez, J. D., ene 1 2018, En : Infection, Genetics and Evolution. 57, p. 145-150 6 p.

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vector-borne diseases
Social Conditions
tourism
rural areas
Colombia
4 Citas (Scopus)

Molecular detection and genotyping of pathogenic protozoan parasites in raw and treated water samples from southwest Colombia

Sánchez, C., López, M. C., Galeano, L. A., Qvarnstrom, Y., Houghton, K. & Ramírez, J. D., oct 26 2018, En : Parasites and Vectors. 11, 1, p. 563

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2016
61 Citas (Scopus)

Geographic distribution of human Blastocystis subtypes in South America

Ramírez, J. D., Sánchez, A., Hernández, C., Flórez, C., Bernal, M. C., Giraldo, J. C., Reyes, P., López, M. C., García, L., Cooper, P. J., Vicuña, Y., Mongi, F. & Casero, R. D., jul 1 2016, En : Infection, Genetics and Evolution. 41, p. 32-35 3 p.

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Acceso abierto
Blastocystis
South America
geographical distribution
protist
Stramenopiles
2019

Temporal Variation of the Presence of Rhodnius prolixus (Hemiptera: Reduviidae) Into Rural Dwellings in the Department of Casanare, Eastern Colombia

Rincón-Galvis, H. J., Urbano, P., Hernández, C. & Ramírez, J. D., dic 30 2019, En : Journal of Medical Entomology. 57, 1, p. 173-180 8 p.

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Genomic epidemiology supports multiple introductions and cryptic transmission of Zika virus in Colombia

Black, A., Moncla, L. H., Laiton-Donato, K., Potter, B., Pardo, L., Rico, A., Tovar, C., Rojas, D. P., Longini, I. M., Halloran, M. E., Peláez-Carvajal, D., Ramírez, J. D., Mercado-Reyes, M. & Bedford, T., nov 12 2019, En : BMC Infectious Diseases. 19, 1, 1 p.

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Acceso abierto
2018
3 Citas (Scopus)

New insights into Clostridium difficile (CD) infection in Latin America: Novel description of toxigenic profiles of diarrhea-associated to CD in Bogotá, Colombia

Rios-Chaparro, D. I., Herrera, G., SOTO, SARA., BICHERNALL, CLAUDIA., PINILLA, DARIO., PARDO-OVIEDO, JUAN. M., JOSA, DIEGO., Patarroyo, M. A., RAMIREZ, JUAN. DAVID. & Muñoz, C. M., 2018, En : Frontiers in Microbiology. 9, p. 74 1 p.

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2 Citas (Scopus)

Comparison of parasite loads in serum and blood samples from patients in acute and chronic phases of Chagas disease

Hernández, C., Teherán, A., Flórez, C. & Ramírez, J. D., abr 17 2018, (En prensa) En : Parasitology. p. 1-7 7 p.

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2019

Trypanosoma cruzi infection, discrete typing units and feeding sources among Psammolestes arthuri (Reduviidae: Triatominae) collected in eastern Colombia

Velásquez-Ortiz, N., Hernández, C., Herrera, G., Cruz-Saavedra, L., Higuera, A., Arias-Giraldo, L. M., Urbano, P., Cuervo, A., Teherán, A. & Ramírez, J. D., abr 8 2019, En : Parasites and Vectors. 12, 1, p. 157

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2016
21 Citas (Scopus)

Molecular Diagnosis of Chagas Disease in Colombia: Parasitic Loads and Discrete Typing Units in Patients from Acute and Chronic Phases

Hernández, C., Cucunubá, Z., Flórez, C., Olivera, M., Valencia, C., Zambrano, P., León, C. & Ramírez, J. D., sep 20 2016, En : PLoS Neglected Tropical Diseases.

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Parasite Load
Colombia
Chagas Disease
Parasites
Parasitemia
2019
6 Citas (Scopus)

Molecular epidemiology of dengue, yellow fever, Zika and Chikungunya arboviruses: An update

Higuera, A. & Ramírez, J. D., feb 1 2019, En : Acta Tropica. 190, p. 99-111 13 p.

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2017
2 Citas (Scopus)

Ecology of Trypanosoma cruzi I genotypes across Rhodnius prolixus captured in Attalea butyracea palms

Poveda, C., Higuera, A., Urbano, P. & Ramírez, J. D., abr 1 2017, En : Infection, Genetics and Evolution. p. 146-150 5 p.

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Attalea
Rhodnius
Rhodnius prolixus
Trypanosoma cruzi
Ecology
2019
5 Citas (Scopus)

Taxonomical over splitting in the Rhodnius prolixus (Insecta: Hemiptera: Reduviidae) clade: Are R. Taquarussuensis (da Rosa et al., 2017) and R. Neglectus (Lent, 1954) the same species?

Nascimento, J. D., Da Rosa, J. A., Salgado-Roa, F. C., Hernández, C., Pardo-Diaz, C., Alevi, K. C. C., Ravazi, A., De Oliveira, J., de Azeredo Oliveira, M. T. V., Salazar, C. & Ramírez, J. D., feb 1 2019, En : PLoS One. 14, 2, e0211285.

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Acceso abierto
2016
20 Citas (Scopus)

Prevalence of Trypanosoma cruzi's Discrete Typing Units in a cohort of Latin American migrants in Spain

Martinez-Perez, A., Poveda, C., Ramírez, J. D., Norman, F., Gironés, N., Guhl, F., Monge-Maillo, B., Fresno, M. & López-Vélez, R., may 1 2016, En : Acta Tropica. p. 145-150 6 p.

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Trypanosoma cruzi
Spain
Bolivia
Chagas Disease
Blood Grouping and Crossmatching
8 Citas (Scopus)

Murine models susceptibility to distinct Trypanosoma cruzi I genotypes infection

LEÓN, CIELO. M., MONTILLA, MARLENY., VANEGAS, RICARDO., CASTILLO, MARIA., PARRA, EDGAR. & RAMÍREZ, JUAN. DAVID., nov 10 2016, En : Parasitology. p. 1-8 8 p.

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Trypanosoma cruzi
Parasitemia
parasitemia
animal models
Genotype
2018
3 Citas (Scopus)

Geospatial-temporal distribution of Tegumentary Leishmaniasis in Colombia (2007–2016)

Herrera, G., Teherán, A., Pradilla, I., Vera, M. & Ramírez, J. D., abr 6 2018, En : PLoS Neglected Tropical Diseases. 12, 4, e0006419.

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2017
48 Citas (Scopus)

Blastocystis subtyping and its association with intestinal parasites in children from different geographical regions of Colombia

Ramirez Gonzalez, J. D., Florez, C., Bernal, M. C. & Giraldo, J. C., feb 21 2017, En : PLoS One. 12, 2

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2019

Genetic diversification of Panstrongylus geniculatus (Reduviidae: Triatominae) in northern South America

Caicedo-Garzón, V., Salgado-Roa, F. C., Sánchez-Herrera, M., Hernández, C., Arias-Giraldo, L. M., García, L., Vallejo, G., Cantillo, O., Tovar, C., Da Rosa, J. A., Carrasco, H. J., Segovia, M., Salazar, C. & Ramírez, J. D., ene 1 2019, En : PLoS One. 14, 10, e0223963.

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Acceso abierto

Genomic analyses reveal moderate levels of ploidy, high heterozygosity and structural variations in a Colombian isolate of Leishmania (Leishmania) amazonensis

Patino, L. H., Muskus, C., Muñoz, M. & Ramírez, J. D., dic 29 2019, En : Acta Tropica. 203, 105296.

Resultado de la investigación: Contribución a una revistaArtículo

3 Citas (Scopus)

Major changes in chromosomal somy, gene expression and gene dosage driven by SbIII in Leishmania braziliensis and Leishmania panamensis

Patino, L. H., Imamura, H., Cruz-Saavedra, L., Pavia, P., Muskus, C., Méndez, C., Dujardin, J. C. & Ramírez, J. D., dic 1 2019, En : Scientific Reports. 9, 1, 9485.

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Acceso abierto
1 Cita (Scopus)

Molecular and descriptive epidemiology of intestinal protozoan parasites of children and their pets in Cauca, Colombia: A cross-sectional study

Villamizar, X., Higuera, A., Herrera, G., Vasquez-A, L. R., Buitron, L., Muñoz, L. M., Gonzalez-C, F. E., Lopez, M. C., Giraldo, J. C. & Ramírez, J. D., feb 26 2019, En : BMC Infectious Diseases. 19, 1, 190.

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Acceso abierto
3 Citas (Scopus)

A summary of Blastocystis subtypes in North and South America

Jiménez, P. A., Jaimes, J. E. & Ramírez, J. D., jul 29 2019, En : Parasites and Vectors. 12, 1, 376.

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Acceso abierto

Evaluation of four rapid diagnostic tests for canine and human visceral Leishmaniasis in Colombia

Herrera, G., Castillo, A., Ayala, M. S., Flórez, C., Cantillo-Barraza, O. & Ramirez, J. D., ago 27 2019, En : BMC Infectious Diseases. 19, 1, 747.

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Acceso abierto

Transcriptional responses of Leishmania (Leishmania) amazonensis in the presence of trivalent sodium stibogluconate

Patino, L. H., Muskus, C. & Ramírez, J. D., jul 12 2019, En : Parasites and Vectors. 12, 1, 348.

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Acceso abierto
2017
21 Citas (Scopus)

Blastocystis subtyping and its association with intestinal parasites in children from different geographical regions of Colombia

Ramírez, J. D., Flórez, C., Olivera, M. J., Bernal, M. C. & Giraldo, J. C., feb 1 2017, En : PLoS One. 12, 2, e0172586.

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Blastocystis
Geographical regions
Colombia
Parasites
Alleles
2019
1 Cita (Scopus)

Ecological niche modelling for predicting the risk of cutaneous leishmaniasis in the Neotropical moist forest biome

Chavy, A., Nava, A. F. D., Luz, S. L. B., Ramírez, J. D., Herrera, G., Dos Santos, T. V., Ginouves, M., Demar, M., Prévot, G., Guégan, J. F. & De Thoisy, B., ene 1 2019, En : PLoS Neglected Tropical Diseases. 13, 8, e0007629.

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Acceso abierto
2017
6 Citas (Scopus)

Determining Clostridium difficile intra-taxa diversity by mining multilocus sequence typing databases

Muñoz, C. M., Ríos-Chaparro, D. I., Patarroyo, M. A. & Ramírez, J. D., mar 14 2017, En : BMC Microbiology. 17, 1, p. 1-12 12 p., 62.

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Multilocus Sequence Typing
Clostridium difficile
Databases
Essential Genes
Population
2019
1 Cita (Scopus)

Comparative genomics identifies potential virulence factors in Clostridium tertium and C. paraputrificum

Muñoz, M., Restrepo-Montoya, D., Kumar, N., Iraola, G., Herrera, G., Ríos-Chaparro, D. I., Díaz-Arévalo, D., Patarroyo, M. A., Lawley, T. D. & Ramírez, J. D., ene 1 2019, En : Virulence. 10, 1, p. 657-676 20 p.

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Acceso abierto
1 Cita (Scopus)

Evaluation of the multispecies coalescent method to explore intra-Trypanosoma cruzi I relationships and genetic diversity

Gómez-Hernández, C., Pérez, S. D., Rezende-Oliveira, K., Barbosa, C. G., Lages-Silva, E., Ramírez, L. E. & Ramírez, J. D., may 3 2019, En : Parasitology. p. 1-12 12 p.

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