Meta-analysis of published molecular epidemiology data of the Cryptococcus neoformans and C. gattii species complexes using the ISHAM MLST consensus

Título traducido de la contribución: Metaanálisis de los datos epidemiológicos moleculares publicados de los complejos de especies de Cryptococcus neoformans y C. gattii utilizando el consenso de ISHAM MLST.

Luciana Trilles, Carolina Firacative, Massimo Cogliati, Wieland Meyer

Resultado de la investigación: Contribución a una conferenciaPóster

Resumen

Objetivo: La criptococosis es una micosis sistémica potencialmente mortal que afecta a seres humanos y animales. El grupo de trabajo de ISHAM sobre "Genotipado de Cryptococcus neoformans/C. gattii", que se utiliza globalmente para tipificar los agentes de la criptococosis, ha establecido un esquema MLST estandarizado. Este esquema incluye siete loci genéticos disociados, los genes CAP59, GPD1, LAC1, PLB1, SOD1, URA5, y la región IGS1. Los tipos de alelos y secuencias se registran en la base de datos MLST: http://mlst.mycologylab.org/. Presentamos un meta-análisis para discutir la epidemiología molecular mundial de los complejos de especies de C. neoformans/C. gattii basado en los datos actualmente publicados. Métodos: Al menos 47 documentos han presentado datos utilizando el esquema de consenso de ISHAM MLST y/o la base de datos de MLST hasta 2017. De ellos, sólo 23 incluyeron la lista de cepas, que representaban 1849 C. neoformans y 1141 C. gattii, cepas complejas de especies de 51 países. Resultados: La mayoría de las cepas analizadas por el MLST son VNI (51%) seguidas por VGII (25%), VGI (8%), VGIII (6%), VNIV (5%), VNII (3%), VNB y VNIV (1% cada una). Se identificaron un total de 465 tipos de secuencia (ST), 241 para el complejo de especies de C. neoformans y 224 para el complejo de especies de C. gattii. La diversidad de haplotipos (Hd) y nucleótidos (Pi) de los siete loci concatenados variaba según el tipo molecular principal y el continente de origen de las cepas. La población más diversa genéticamente se encontró entre las cepas de VNB en África. La VNIV en Europa, la VGII en América del Sur y la VGIII en América del Norte también mostraron una alta diversidad genética. El análisis del árbol de extensión mínima muestra que la población de VNI incluye dos grupos principales, uno que contiene predominantemente STs de Asia y el otro que contiene STs de Europa. Algunas TS son exclusivas de un continente específico y otras están presentes en todo el mundo, pero predominan en diferentes regiones, por ejemplo, en el caso de C. neoformans, las ST 4, 5, 6 y 31 son más frecuentes en Asia; las ST 1, 71, 77 y 93 predominan en Sudamérica; las ST 32 y 69 en África; y las ST 23, 59 y 63 en Europa. El VNB procede casi exclusivamente de África y el VNIV de Europa, pero también se informa ocasionalmente de ellos en otros continentes. Se observan patrones regionales similares entre los subtipos del complejo de especies de C. gattii, ST156 es exclusivo de Europa, ST6 de Norteamérica, pero las STs 51 y 7 se encuentran en varios continentes. La mayoría de las cepas complejas de C. neoformans (51%) tenían datos de factores de riesgo, con la presencia de factores de riesgo para adquirir criptococosis que variaban enormemente, del 100% (para todas las ST VNB) al 9% (para VNIV, ST324). Sólo el 7.7% de los casos de C. gattii tienen datos de factores de riesgo, y los números por TS son demasiado pequeños para hacer cualquier asociación. El análisis estadístico demuestra que las poblaciones con una mayor diversidad genética están asociadas con una mayor tasa de apareamiento de cepas de tipo a, lo que sugiere que la reproducción sexual es la principal vía de recombinación dentro de los complejos de especies de C. neoformans y C. gattii. Conclusión: Este trabajo destaca el significativo progreso que se ha hecho en todo el mundo hacia la tipificación de los aislados criptocócicos, que contribuyen a comprender la estructura de la población de estas levaduras de importancia médica.
Título traducido de la contribuciónMetaanálisis de los datos epidemiológicos moleculares publicados de los complejos de especies de Cryptococcus neoformans y C. gattii utilizando el consenso de ISHAM MLST.
Idioma originalInglés estadounidense
PáginasS37
Número de páginas1
EstadoPublicada - jul 2018
Evento20th Congress of the International Society for Human and Animal Mycology - Amsterdam, Países Bajos
Duración: jun 30 2018jul 4 2018
https://www.isham2018.org/en/Home_10_6_12.html

Conferencia

Conferencia20th Congress of the International Society for Human and Animal Mycology
Título abreviado20th Congress ISHAM
País/TerritorioPaíses Bajos
CiudadAmsterdam
Período6/30/187/4/18
Dirección de internet

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