The structure of associations: Method insights from analyzing 28 clinical isolates of Cryptococcus neoformans

Los aislados clínicos de un patógeno fúngico procedentes de una única región o país suelen presentar clonalidad estructural o agrupación filogenética a nivel de secuencia o MLST; dicha estructura poblacional puede persistir también en muestras más amplias. En un esfuerzo por mejorar la comprensión causal de la patogénesis a nivel molecular, se han aplicado a los hongos métodos de cribado de asociación de todo el genoma diseñados inicialmente para otros reinos. El ejemplo de un conjunto de datos colombianos de 28 aislados clínicos de Cryptococcus neoformans VNI indica dónde puede ser necesario analizar de nuevas formas los resultados de los procesos estándar para extraer de forma eficiente hipótesis para experimentos a partir de datos fúngicos genotipo-fenotipo.