SISTEMA DE CONTEO AUTOMÁTICO DE COLONIAS DE CÉLULAS TUMORALES

Lizeth Rodriguez-Ramos, María Fernanda Rojas-Castro, Nicolás Roldán-fajardo, Karen Cepeda-Forero, Alejandro Ondo-Méndez, Juan Manuel López-López, Manuel Forero

Resultado de la investigación: Tipos de Contribuciónes en ConferenciaPaper

Resumen

Radiobiology, which studies the effect of radiation-matter interaction in biological systems, is a fundamental area for the optimization of cancer treatment by radiotherapy. One of the most commonly used techniques in radiobiology is clonogenic (or colony formation) assays, which seek to measure the loss in cell division capacity in a tumour cell after it has been treated with ionising radiation. The analysis of the data obtained by this technique requires counting the colonies formed from hundreds of initially irradiated and cultured cells. Although there are some automatic colony counting systems, they are generally very expensive and/or only partially automatic. For this reason, in most cases the counting is done manually, making it a tedious and imprecise process. To solve this problem, radiobiologists, engineers and students of biomedical engineering and medicine from three universities came together to develop a strategy to facilitate the collection of data from cloned trials. This paper presents a new automatic method for counting colonies from clonogenic trials, based on image processing techniques. The results obtained with the automatic system were compared with manual counts to verify the quality and precision of the proposed method. With this new technique, it is expected to contribute to the development of practical solutions in the radiobiological field, which help to improve the obtaining of experimental data leading to propose solutions, from the laboratory, to health problems in the area of radio-oncology.
Idioma originalSpanish (Colombia)
EstadoPublished - ago 6 2018
EventoEncuentro Internacional de Educación en Ingeniería 2018 - Hyatt Regency, Cartagena
Duración: sep 18 2018sep 21 2018

Conference

ConferenceEncuentro Internacional de Educación en Ingeniería 2018
Título abreviadoeiei
PaísColombia
CiudadCartagena
Período9/18/189/21/18

Citar esto

Rodriguez-Ramos, L., Rojas-Castro, M. F., Roldán-fajardo, N., Cepeda-Forero, K., Ondo-Méndez, A., López-López, J. M., & Forero, M. (2018). SISTEMA DE CONTEO AUTOMÁTICO DE COLONIAS DE CÉLULAS TUMORALES. Papel presentado en Encuentro Internacional de Educación en Ingeniería 2018, Cartagena, .
Rodriguez-Ramos, Lizeth ; Rojas-Castro, María Fernanda ; Roldán-fajardo, Nicolás ; Cepeda-Forero, Karen ; Ondo-Méndez, Alejandro ; López-López, Juan Manuel ; Forero, Manuel. / SISTEMA DE CONTEO AUTOMÁTICO DE COLONIAS DE CÉLULAS TUMORALES. Papel presentado en Encuentro Internacional de Educación en Ingeniería 2018, Cartagena, .
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title = "SISTEMA DE CONTEO AUTOM{\'A}TICO DE COLONIAS DE C{\'E}LULAS TUMORALES",
abstract = "La radiobiolog{\'i}a, que estudia el efecto de la interacci{\'o}n radiaci{\'o}n-materia en sistemas biol{\'o}gicos, es un {\'a}rea fundamental para la optimizaci{\'o}n del tratamiento del c{\'a}ncer por radioterapia. Una de las t{\'e}cnicas m{\'a}s utilizadas en radiobiolog{\'i}a son los ensayos clonog{\'e}nicos (o de formaci{\'o}n de colonias), que buscan medir la p{\'e}rdida en la capacidad de divisi{\'o}n celular en una c{\'e}lula tumoral despu{\'e}s de haber sido tratada con radiaci{\'o}n ionizante. El an{\'a}lisis de los datos obtenidos por esta t{\'e}cnica requiere del conteo de las colonias formadas a partir de cientos de c{\'e}lulas inicialmente irradiadas y cultivadas. Aunque existen algunos sistemas autom{\'a}ticos para el conteo de colonias, estos son en general muy costosos y/o s{\'o}lo parcialmente autom{\'a}ticos. Por esta raz{\'o}n, en la mayor{\'i}a de los casos el conteo se realiza de forma manual, haciendo de {\'e}ste un proceso tedioso e impreciso. Para solucionar este problema, radiobi{\'o}logos, ingenieros y estudiantes de ingenier{\'i}a biom{\'e}dica y medicina de tres universidades, se unieron para desarrollar una estrategia que facilite la obtenci{\'o}n de los datos de los ensayos clonog{\'e}nicos. En este trabajo se presenta un nuevo m{\'e}todo autom{\'a}tico para el conteo de colonias de ensayos clonog{\'e}nicos, basado en t{\'e}cnicas de procesamiento de im{\'a}genes. Se compararon los resultados obtenidos con el sistema autom{\'a}tico con conteos manuales para verificar la calidad y precisi{\'o}n del m{\'e}todo propuesto. Con esta nueva t{\'e}cnica, se espera aportar al desarrollo de soluciones pr{\'a}cticas en el {\'a}mbito radiobiol{\'o}gico, que ayuden a mejorar la obtenci{\'o}n de datos experimentales conducentes a proponer soluciones, desde el laboratorio, a problemas de salud en el {\'a}rea de la radio-oncolog{\'i}a",
author = "Lizeth Rodriguez-Ramos and Rojas-Castro, {Mar{\'i}a Fernanda} and Nicol{\'a}s Rold{\'a}n-fajardo and Karen Cepeda-Forero and Alejandro Ondo-M{\'e}ndez and L{\'o}pez-L{\'o}pez, {Juan Manuel} and Manuel Forero",
year = "2018",
month = "8",
day = "6",
language = "Espa{\~n}ol (Colombia)",
note = "Encuentro Internacional de Educaci{\'o}n en Ingenier{\'i}a 2018, eiei ; Conference date: 18-09-2018 Through 21-09-2018",

}

Rodriguez-Ramos, L, Rojas-Castro, MF, Roldán-fajardo, N, Cepeda-Forero, K, Ondo-Méndez, A, López-López, JM & Forero, M 2018, 'SISTEMA DE CONTEO AUTOMÁTICO DE COLONIAS DE CÉLULAS TUMORALES' Papel presentado en, Cartagena, 9/18/18 - 9/21/18, .

SISTEMA DE CONTEO AUTOMÁTICO DE COLONIAS DE CÉLULAS TUMORALES. / Rodriguez-Ramos, Lizeth; Rojas-Castro, María Fernanda; Roldán-fajardo, Nicolás; Cepeda-Forero, Karen; Ondo-Méndez, Alejandro; López-López, Juan Manuel; Forero, Manuel.

2018. Papel presentado en Encuentro Internacional de Educación en Ingeniería 2018, Cartagena, .

Resultado de la investigación: Tipos de Contribuciónes en ConferenciaPaper

TY - CONF

T1 - SISTEMA DE CONTEO AUTOMÁTICO DE COLONIAS DE CÉLULAS TUMORALES

AU - Rodriguez-Ramos, Lizeth

AU - Rojas-Castro, María Fernanda

AU - Roldán-fajardo, Nicolás

AU - Cepeda-Forero, Karen

AU - Ondo-Méndez, Alejandro

AU - López-López, Juan Manuel

AU - Forero, Manuel

PY - 2018/8/6

Y1 - 2018/8/6

N2 - La radiobiología, que estudia el efecto de la interacción radiación-materia en sistemas biológicos, es un área fundamental para la optimización del tratamiento del cáncer por radioterapia. Una de las técnicas más utilizadas en radiobiología son los ensayos clonogénicos (o de formación de colonias), que buscan medir la pérdida en la capacidad de división celular en una célula tumoral después de haber sido tratada con radiación ionizante. El análisis de los datos obtenidos por esta técnica requiere del conteo de las colonias formadas a partir de cientos de células inicialmente irradiadas y cultivadas. Aunque existen algunos sistemas automáticos para el conteo de colonias, estos son en general muy costosos y/o sólo parcialmente automáticos. Por esta razón, en la mayoría de los casos el conteo se realiza de forma manual, haciendo de éste un proceso tedioso e impreciso. Para solucionar este problema, radiobiólogos, ingenieros y estudiantes de ingeniería biomédica y medicina de tres universidades, se unieron para desarrollar una estrategia que facilite la obtención de los datos de los ensayos clonogénicos. En este trabajo se presenta un nuevo método automático para el conteo de colonias de ensayos clonogénicos, basado en técnicas de procesamiento de imágenes. Se compararon los resultados obtenidos con el sistema automático con conteos manuales para verificar la calidad y precisión del método propuesto. Con esta nueva técnica, se espera aportar al desarrollo de soluciones prácticas en el ámbito radiobiológico, que ayuden a mejorar la obtención de datos experimentales conducentes a proponer soluciones, desde el laboratorio, a problemas de salud en el área de la radio-oncología

AB - La radiobiología, que estudia el efecto de la interacción radiación-materia en sistemas biológicos, es un área fundamental para la optimización del tratamiento del cáncer por radioterapia. Una de las técnicas más utilizadas en radiobiología son los ensayos clonogénicos (o de formación de colonias), que buscan medir la pérdida en la capacidad de división celular en una célula tumoral después de haber sido tratada con radiación ionizante. El análisis de los datos obtenidos por esta técnica requiere del conteo de las colonias formadas a partir de cientos de células inicialmente irradiadas y cultivadas. Aunque existen algunos sistemas automáticos para el conteo de colonias, estos son en general muy costosos y/o sólo parcialmente automáticos. Por esta razón, en la mayoría de los casos el conteo se realiza de forma manual, haciendo de éste un proceso tedioso e impreciso. Para solucionar este problema, radiobiólogos, ingenieros y estudiantes de ingeniería biomédica y medicina de tres universidades, se unieron para desarrollar una estrategia que facilite la obtención de los datos de los ensayos clonogénicos. En este trabajo se presenta un nuevo método automático para el conteo de colonias de ensayos clonogénicos, basado en técnicas de procesamiento de imágenes. Se compararon los resultados obtenidos con el sistema automático con conteos manuales para verificar la calidad y precisión del método propuesto. Con esta nueva técnica, se espera aportar al desarrollo de soluciones prácticas en el ámbito radiobiológico, que ayuden a mejorar la obtención de datos experimentales conducentes a proponer soluciones, desde el laboratorio, a problemas de salud en el área de la radio-oncología

M3 - Artículo

ER -

Rodriguez-Ramos L, Rojas-Castro MF, Roldán-fajardo N, Cepeda-Forero K, Ondo-Méndez A, López-López JM y otros. SISTEMA DE CONTEO AUTOMÁTICO DE COLONIAS DE CÉLULAS TUMORALES. 2018. Papel presentado en Encuentro Internacional de Educación en Ingeniería 2018, Cartagena, .