Molecular type distribution and fluconazole susceptibility of clinical Cryptococcus gattii isolates from South African laboratory-based surveillance, 2005–2013

Como ocurre en todo el mundo, Cryptococcus gattii es una causa menos frecuente de criptococosis que Cryptococcus neoformans en Sudáfrica. Se realizó la tipificación de secuencias multilocus (MLST) y pruebas de susceptibilidad al fluconazol de 146 aislados seleccionados al azar de 750 pacientes sudafricanos con enfermedad por C. gattii identificados a través de la vigilancia de laboratorio mejorada, de 2005 a 2013. El tipo molecular dominante fue VGIV (101/146, 70%), seguido de VGI (40/146, 27%), VGII (3/146, 2%) y VGIII (2/146, 1%). Entre los 146 aislados de C. gattii, se identificaron 99 tipos de secuencia (ST) diferentes, siendo ST294 (14/146, 10%) y ST155 (10/146, 7%) los más comúnmente observados. Los valores MIC50 y MIC90 de fluconazol de 105 (de 146) aislados de C. gattii seleccionados al azar fueron de 4 μg/ml y 16 μg/ml, respectivamente. Los aislados VGIV tenían un valor MIC50 más bajo en comparación con los aislados no VGIV, pero estos valores estaban dentro de una doble dilución entre sí. Los pacientes seropositivos tenían una probabilidad ajustada diez veces mayor de infección por VGIV en comparación con los pacientes seronegativos, aunque con números pequeños (99/136; 73% frente a 2/10; 20%), el intervalo de confianza (IC) era amplio (IC 95%: 1,93-55,31; p = 0,006). La filogenia del genoma completo de 98 aislados del tipo molecular más prevalente en Sudáfrica, el VGIV, identificó que este tipo molecular es muy diverso, con dos interesantes conglomerados de diez y seis aislados estrechamente relacionados, respectivamente. Uno de estos grupos estaba formado únicamente por pacientes de la provincia sudafricana de Mpumalanga, lo que sugiere una fuente ambiental similar. Este estudio aportó nuevos conocimientos sobre la estructura de la población mundial de este importante patógeno humano.