Molecular epidemiology reveals low genetic diversity among Cryptococcus neoformans isolates from people living with HIV in Lima, Peru, during the pre-HAART

La criptococosis, una micosis que se presenta principalmente como meningoencefalitis y que afecta predominantemente a personas infectadas con el virus de la inmunodeficiencia humana (VIH), es causada principalmente por Cryptococcus neoformans. Se estudió retrospectivamente la variación genética de 48 aislamientos de C. neoformans, recuperados de 20 personas VIH positivas en Lima, Perú, durante la era anterior a la terapia antirretroviral de gran actividad (TARGA). El tipo de apareamiento de los aislamientos se determinó por PCR y el serotipo por aglutinación y polimorfismo de longitud de fragmentos de restricción CAP59 (RFLP). La diversidad genética se evaluó por URA5-RFLP, PCR-fingerprinting, polimorfismo de longitud de fragmentos amplificados (AFLP) y tipificación de secuencias multilocus (MLST). Todos los aislamientos fueron de tipo de apareamiento alfa, con 39 tipos moleculares VNI, siete VNII, correspondientes al serotipo A de C. neoformans var. grubii, y dos híbridos VNIII AD. En general, la población criptocócica de personas VIH positivas en Lima muestra un bajo grado de diversidad genética. En la mayoría de los pacientes con infección criptocócica persistente, se recuperó el mismo genotipo durante el seguimiento. En cuatro pacientes con recaída y uno con fracaso terapéutico, se encontraron genotipos diferentes en los aislamientos de la reinfección y del aislamiento recuperado al final del tratamiento. En un paciente, se encontraron dos genotipos en el primer episodio de criptococosis. Este estudio aporta datos de Perú al análisis genético poblacional mundial en curso de Cryptococcus.