Molecular epidemiology of Cryptococcus neoformans and Cryptococcus gattii in Latin America

Objetivo: Combinar y analizar los datos reportados desde América Latina que han contribuido a la identificación, genotipado, epidemiología molecular, distribución geográfica, identificación de nichos ecológicos y genética poblacional de los agentes etiológicos de la criptococosis, una micosis potencialmente mortal adquirida del medio ambiente, causada por las levaduras encapsuladas Cryptococcus neoformans y C. gattii. En América Latina, el estudio de la criptococosis y sus agentes etiológicos ha cobrado cada vez más importancia.
ya que esta micosis tiene una morbimortalidad significativa, con más de 5000 individuos afectados con meningitis criptocócica anualmente y 2400 muertes anuales atribuibles. Además, el número de pacientes inmunocomprometidos en la región aumenta constantemente, con alrededor de 100.000 nuevas infecciones por el VIH al año, que es la principal condición que predispone a la criptococosis. Métodos: La búsqueda de los estudios sobre epidemiología molecular de Cryptococcus y criptococosis se realizó en inglés y español en bases de datos de PubMed y Google utilizando las palabras clave "cryptococcus" o "cryptococcosis" combinadas con cada nombre de los 20 países latinoamericanos. Resultados: El análisis de los datos moleculares combinados de 2110 aislamientos de criptococos clínicos y 1029 ambientales aislados de América Latina mostró que, como en todo el mundo, C. neoformans molecular tipo VNI es la causa más común de criptococosis (69.6%), afectando predominantemente a pacientes con VIH, seguido por C. gattii molecular tipo VGII (16.1%), que generalmente afecta a individuos que por lo demás son saludables. Curiosamente, en el medio ambiente estos dos tipos moleculares también predominan con proporciones ligeramente diferentes (55,1% para VNI y 26,7% para VGII). Sin embargo, mientras que el reservorio ambiental de C. neoformans es principalmente guano aviar, materia orgánica en descomposición y suelo, el nicho de C. gattii está asociado con varias especies de árboles. En Brasil y Colombia, los países con el mayor número de aislados, VNI y VGII son los tipos moleculares más comunes, aunque en Colombia, la prevalencia de VGIII es muy similar a la de VGII. En México y Argentina, sin embargo, después del VNI, los tipos moleculares VGIII y VGI son los más comunes entre los aislados de C. gattii, respectivamente. Mediante la tipificación de secuencias multilocales y la secuenciación del genoma completo, también se ha logrado un mayor avance para comprender las poblaciones de C. gattii en América Latina. En primer lugar, el estudio global de los aislados de C. gattii VGII proporcionó evidencia sobre la evolución de este patógeno en América del Norte y dio soporte a la extensa evolución y dispersión desde América del Sur, muy probablemente desde la Amazonía y el Noreste de Brasil, donde las cepas de VGII han demostrado ser las más variables genéticamente comparadas con los aislados mundiales. Además, se ha propuesto que México y Colombia sean el origen probable de la población de VGIII, ya que los aislados de estos países son el grupo basal de aislados recuperados en todo el mundo. Conclusión: Este trabajo resume los avances significativos que se han logrado en los últimos años hacia la epidemiología molecular de los aislados criptocócicos en América Latina, que contribuyen a comprender cómo se han propagado estas levaduras patógenas en todo el mundo y cuál es su estructura poblacional, y a definir mejor algunos aspectos de la enfermedad de la criptococosis, una micosis importante en la región.