Molecular detection and genotyping of intestinal protozoa from different biogeographical regions of Colombia

Antecedentes: Los protozoos parasitarios intestinales representan un grave problema de salud pública, especialmente en los países en desarrollo. Protozoos como Blastocystis, Giardia intestinalis, Entamoeba histolytica y Cryptosporidium spp. están asociados con síntomas diarreicos. En Colombia, existen pocos datos específicos de la región sobre la frecuencia y los genotipos/especies circulantes de estos microorganismos. Por lo tanto, el objetivo principal de nuestro estudio fue emplear la detección y genotipificación molecular de G. intestinalis y Blastocystis, Cryptosporidium y Entamoeba spp. en muestras de diferentes regiones biogeográficas de Colombia. Métodos: Se recolectaron 649 muestras fecales humanas de cinco regiones biogeográficas de Colombia: Amazonas, Andina, Caribe, Orinoquía y Pacífico. Se detectaron Blastocystis, G. intestinalis, Cryptosporidium spp. y el complejo Entamoeba mediante microscopía y PCR convencional. Se realizó la genotipificación molecular para identificar los subtipos de Blastocystis (ST) (18s), los conjuntos de G. intestinalis (triosa fosfato isomerasa y glutamato deshidrogenasa) y las especies de Cryptosporidium (18s). Los índices de diversidad genética se determinaron mediante dnasp.5. Resultados: Se detectó G. intestinalis en el 45,4% (n = 280) de las muestras, Blastocystis en el 54,5% (n = 336) de las muestras, Cryptosporidium spp. en el 7,3% (n = 45) de las muestras, Entamoeba dispar en el 1,5% (n = 9) de las muestras y Entamoeba moshkovskii en el 0,32% (n = 2) de las muestras. Se identificaron los STs 1-4, 8 y 9 de Blastocystis y los conjuntos AII, BIII, BIV, D y G de G. intestinalis. Se identificaron las siguientes especies de Cryptosporidium: C. hominis, C. parvum, C. bovis, C. andersoni, C. muris, C. ubiquitum y C. felis. La región del Caribe presentó la mayor frecuencia para cada uno de los microorganismos evaluados (91,9% para G. duodenalis, 97,3% para Blastocystis, 10,8% para Cryptosporidium spp., 13,5% para E. dispar y 2,7% para E. moshkovskii). La región del Orinoco tuvo una alta frecuencia de Blastocystis (97,2%) y la región andina tuvo una alta frecuencia de G. intestinalis (69,4%). Se evidenció una transmisión alta y activa en varias regiones del país, lo que implica que se deben mejorar los mecanismos de prevención y control de las parasitosis intestinales en diferentes zonas del país.