Invasive candidiasis by Candida non-albicans and non-auris in a fourth level hospital in Colombia: epidemiology, antifungal susceptibility and genetic diversity

Objetivos. Las infecciones por Candida, cada vez más frecuentes y asociadas a entornos sanitarios, son muy importantes, ya que algunas especies de este género pueden desarrollar resistencia a los antifúngicos. Nos propusimos estudiar la epidemiología de las infecciones invasoras causadas por Candida non-albicans y non-auris en un hospital de cuarto nivel de Bogotá, Colombia, y determinar el perfil de susceptibilidad antifúngica y la diversidad genética de los agentes etiológicos. Materiales y Métodos. Se estudiaron todos los aislamientos de Candida no albicans y no auris que se reportaron como causantes de infecciones invasoras durante 18 meses. Los aislados se identificaron mediante métodos rutinarios convencionales, incluidos Vitek y MALDITOF. Los pacientes afectados por estas levaduras tenían datos epidemiológicos sobre sexo, edad, tratamiento y desenlace. Además, se determinó la sensibilidad antifúngica de los aislados a nueve antifúngicos mediante microdilución en caldo YeastOne y se secuenció el ADN ribosómico. Se realizaron análisis estadísticos para correlacionar variables epidemiológicas y establecer diferencias de susceptibilidad antifúngica entre especies, por fármaco antifúngico. Resultados. En el período estudiado, se identificaron 68 aislamientos de Candida no albicans y no auris, recuperados de 58 pacientes y que representaban el 48,5% de las candidiasis invasoras. De las especies, 29 (42,6%) eran Candida parapsilosis, 18 (26,5%) Candida glabrata, 17 (25%) Candida tropicalis y 4 (5,9%) Candida dubliniensis. Un aislado de Candida guilliermondii fue notificado por el hospital pero no se incluyó en el estudio debido a la contaminación por moho. Los aislados se recuperaron principalmente de la sangre (50%) y de otros lugares estériles. De los pacientes, la mayoría eran hombres (53,4%). La edad de los pacientes oscilaba entre 18 días y 93 años (media de 63,1 años). La mayoría de los pacientes fueron hospitalizados en la UCI (70,7%) y tratados con fluconazol (36,2%) seguido de caspofungina (32,8%). Un tercio de los pacientes no recibió ningún tratamiento antifúngico. La mortalidad general fue del 46,6%. Sin embargo, se observó que los pacientes afectados por C. glabrata tenían un mayor riesgo de mortalidad (62,5%) que los afectados por otras especies. La mayor mortalidad también se asoció a una edad más avanzada. La susceptibilidad a los antifúngicos mostró que los aislados de C. parapsilosis eran los menos susceptibles a las equinocandinas, en comparación con los aislados de otras especies, mientras que los aislados de C. glabrata eran los menos susceptibles a los azoles, seguidos de los de C. tropicalis. La sensibilidad a la anfotericina B y a la flucitosina no difirió entre las especies. De los aislados, uno de C. glabrata era resistente a la caspofungina, cuatro de C. parapsilosis eran resistentes al fluconazol, dos de C. tropicalis eran resistentes tanto al voriconazol como al fluconazol y otros tres de C. tropicalis eran resistentes a la flucitosina. En general, se identificó una baja diversidad genética entre los aislados. Conclusiones. Este estudio aporta datos epidemiológicos importantes para la vigilancia local y mundial de las especies emergentes de Candida, destacando la importancia de vigilar el aumento de especies poco frecuentes, como C. dubliniensis y C. guilliermondii, y su impacto clínico. Nuestro estudio destaca también la aparición de resistencias adquiridas, que podrían aumentar significativamente las tasas de morbilidad y mortalidad, junto con la dispersión clonal de algunas especies.