Genomic characterization of SARS-CoV-2 and its association with clinical outcomes: a 1-year longitudinal study of the pandemic in Colombia: a 1-year longitudinal study of the pandemic in Colombia

Título traducido de la contribución: Caracterización genómica del SARS-CoV-2 y su asociación con los resultados clínicos: estudio longitudinal de 1 año de la pandemia en Colombia

Ángela María Ruiz-Sternberg, Henry Mauricio Chaparro-Solano, Ludwig L. Albornóz, Ángela María Pinzón-Rondón, Juan Mauricio Pardo-Oviedo, Nicolás Molano-González, Diego Andrés Otero-Rodríguez, Fabio Andrés Zapata-Gómez, Jubby Marcela Gálvez

Producción científica: Contribución a una revistaArtículorevisión exhaustiva

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Resumen

Objetivos: Este estudio tuvo como objetivo explorar las asociaciones entre la caracterización molecular del coronavirus-2 del síndrome respiratorio agudo severo (SARS-CoV-2) y la gravedad de la enfermedad en pacientes ambulatorios y hospitalizados en dos epicentros principales de Colombia durante el primer año de la pandemia de la enfermedad por coronavirus 2019. Métodos: En total, 1000 pacientes con infección por SARS-CoV-2 fueron incluidos en este estudio. Se recogieron datos clínicos de 997 pacientes y se obtuvieron 678 secuencias de genoma completo mediante secuenciación masiva en paralelo. Se realizaron análisis bivariantes, multivariantes y de árbol de clasificación y regresión entre variables clínicas y genómicas. Resultados: La edad >88 años y la infección por los linajes B.1.1, B.1.1.388, B.1.523 o B.1.621 en pacientes de 71-88 años se asociaron con la muerte [odds ratio (OR) 6,048036; intervalo de confianza (IC) del 95%: 1,346567-32,92521; p=0,01718674]. La necesidad de hospitalización se asoció a mayor edad y comorbilidades. La tasa de hospitalización aumentó significativamente en los pacientes de 38-51 años infectados por los linajes A, B, B.1.1.388, B.1.1.434, B.1.153, B.1.36.10, B.1.411, B.1.471, B.1.558 o B.1.621 (OR 8.368427, IC 95% 2.573145-39.10672, P=0.00012). Las asociaciones entre los clados y los resultados clínicos divergieron de los datos comunicados previamente. Conclusiones: La infección por el linaje B.1.621 aumentó las tasas de hospitalización y mortalidad. Estos hallazgos, más el rápido aumento de la prevalencia en Colombia y otros países, sugieren que el linaje B.1.621 debe considerarse como una "variante de interés". Si se confirma la gravedad de la enfermedad asociada, debería considerarse su posible designación como 'variante de interés'.
Título traducido de la contribuciónCaracterización genómica del SARS-CoV-2 y su asociación con los resultados clínicos: estudio longitudinal de 1 año de la pandemia en Colombia
Idioma originalInglés estadounidense
Páginas (desde-hasta)91-100
Número de páginas10
PublicaciónInternational Journal of Infectious Diseases
Volumen116
Fecha en línea anticipadadic. 15 2021
DOI
EstadoPublicada - mar. 2022

Áreas temáticas de ASJC Scopus

  • Microbiología (médica)
  • Enfermedades infecciosas

Huella

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