Genomic analyses reveal moderate levels of ploidy, high heterozygosity and structural variations in a Colombian isolate of Leishmania (Leishmania) amazonensis

Título traducido de la contribución: Los análisis genómicos revelan niveles moderados de ploidía, alta heterocigosidad y variaciones estructurales en un aislado colombiano de Leishmania (Leishmania) amazonensis

Luz H. Patino, Carlos Muskus, Marina Muñoz, Juan David Ramírez

Resultado de la investigación: Contribución a una revistaArtículorevisión exhaustiva

1 Cita (Scopus)

Resumen

Leishmania amazonensis es uno de los agentes causantes de las diferentes formas de leishmaniasis cutánea presentes en América Latina. Esta especie ha sido aislada en humanos y animales (caninos/felinos) en algunas regiones endémicas de Colombia. Por lo tanto, L. amazonensis es de gran relevancia a nivel clínico y epidemiológico en medicina y veterinaria. Hasta ahora, se dispone de muy pocos genomas de esta especie. Aquí, reportamos la secuencia completa del genoma de una cepa de L. amazonensis adaptada al laboratorio y aislada de un paciente humano con manifestación clínica de leishmaniasis cutánea en Colombia. La secuencia del genoma no sólo permitió realizar análisis comparativos inter e intraespecíficos con los genomas secuenciados de cepas de L. amazonensis de diferentes regiones geográficas, sino que también aumentó nuestro conocimiento sobre el comportamiento genómico de esta cepa colombiana de L. amazonensis. Este aislado también fue caracterizado en términos de polimorfismos de un solo nucleótido, cromosomas y variaciones en el número de copias de los genes (CNVs). Los resultados revelaron una aneuploidía moderada, CNVs en genes implicados en la virulencia, el crecimiento y la supervivencia del parásito, y en las distribuciones de los genes multicopia en algunos cromosomas, así como un alto nivel de heterocigosidad. Los datos confirmaron informes anteriores que identificaron variaciones únicas en L. amazonensis, sugiriendo que la aneuploidía puede no tener un alto coste de fitness y puede permitir la rápida generación de diversidad en los parásitos de Leishmania que crecen normalmente.
Título traducido de la contribuciónLos análisis genómicos revelan niveles moderados de ploidía, alta heterocigosidad y variaciones estructurales en un aislado colombiano de Leishmania (Leishmania) amazonensis
Idioma originalInglés estadounidense
Número de artículo105296
PublicaciónActa Tropica
Volumen203
DOI
EstadoPublicada - dic 10 2019

All Science Journal Classification (ASJC) codes

  • Parasitología
  • Veterinaria (miscelánea)
  • Insectos
  • Enfermedades infecciosas

Huella

Profundice en los temas de investigación de 'Los análisis genómicos revelan niveles moderados de ploidía, alta heterocigosidad y variaciones estructurales en un aislado colombiano de Leishmania (Leishmania) amazonensis'. En conjunto forman una huella única.

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