FungalTraits: a user-friendly traits database of fungi and fungus-like stramenopiles

Título traducido de la contribución: FungalTraits: una base de datos de rasgos fácil de usar de hongos y stramenopiles similares a hongos

, Sergei Põlme, Kessy Abarenkov, R. Henrik Nilsson, Björn D. Lindahl, Karina Engelbrecht Clemmensen, Havard Kauserud, Nhu Nguyen, Rasmus Kjøller, Scott T. Bates, Petr Baldrian, Tobias Guldberg Frøslev, Kristjan Adojaan, Alfredo Vizzini, Ave Suija, Donald Pfister, Hans Otto Baral, Helle Järv, Hugo Madrid, Jenni NordénJian Kui Liu, Julia Pawlowska, Kadri Põldmaa, Kadri Pärtel, Kadri Runnel, Karen Hansen, Karl Henrik Larsson, Kevin David Hyde, Marcelo Sandoval-Denis, Matthew E. Smith, Merje Toome-Heller, Nalin N. Wijayawardene, Nelson Menolli, Nicole K. Reynolds, Rein Drenkhan, Sajeewa S.N. Maharachchikumbura, Tatiana B. Gibertoni, Thomas Læssøe, William Davis, Yuri Tokarev, Adriana Corrales, Adriene Mayra Soares, Ahto Agan, Alexandre Reis Machado, Andrés Argüelles-Moyao, Andrew Detheridge, Angelina de Meiras-Ottoni, Annemieke Verbeken, Arun Kumar Dutta, Bao Kai Cui, C. K. Pradeep

Producción científica: Contribución a una revistaArtículo de Investigaciónrevisión exhaustiva

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Resumen

El estilo de vida críptico de la mayoría de los hongos requiere la identificación molecular del gremio en estudios ambientales. Durante las últimas décadas, el rápido desarrollo y la asequibilidad de las herramientas moleculares han mejorado enormemente la comprensión de la diversidad de hongos en todos los ecosistemas y hábitats. Sin embargo, a pesar del progreso de los métodos moleculares, el conocimiento sobre las propiedades funcionales de los taxones de hongos es vago y la interpretación de los estudios ambientales de una manera ecológicamente significativa sigue siendo un desafío. Con el fin de facilitar las asignaciones funcionales y la interpretación ecológica de los estudios ambientales, presentamos una base de datos de características y caracteres de fácil uso FungalTraits que operan a nivel de hipótesis de género y especie. Combinando la información de esfuerzos anteriores como FUNGuild y FunFun junto con la participación del conocimiento experto, volvimos a anotar 10,210 y 151 géneros de hongos y Stramenopila, respectivamente. Esto resultó en un conjunto de datos de hoja de cálculo independiente que cubre 17 rasgos relacionados con el estilo de vida de los géneros de hongos y Stramenopila, diseñado para asignaciones funcionales rápidas de estudios ambientales. Para asignar los estados de rasgo a las hipótesis de especies de hongos, la comunidad científica de expertos categorizó y asignó manualmente la información de rasgo disponible a 697.413 secuencias de ITS de hongos. Sobre la base de esas secuencias, pudimos resumir la información del rasgo y del huésped en 92.623 hipótesis de especies de hongos con un umbral de disimilitud del 1%.
Título traducido de la contribuciónFungalTraits: una base de datos de rasgos fácil de usar de hongos y stramenopiles similares a hongos
Idioma originalInglés estadounidense
Páginas (desde-hasta)1-16
Número de páginas16
PublicaciónFungal Diversity
Volumen105
N.º1
DOI
EstadoPublicada - nov. 2020

Áreas temáticas de ASJC Scopus

  • Ecología, evolución, comportamiento y sistemática
  • Ecología

Huella

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