Development of a multilocus sequence typing scheme for giardia intestinalis

Giardia intestinalis es un protozoo intestinal que se encuentra con mayor frecuencia en los seres humanos. Se ha agrupado en 8 conjuntos (A-H). Marcadores como el gen de la glutamato deshidrogenasa, la triosa fosfato isomerasa y la beta-giardina (β-giardina) han sido ampliamente utilizados para el genotipado. Además, se han propuesto diferentes dianas genéticas como alternativa valiosa para evaluar la diversidad y la genética de este microorganismo. Así, nuestro objetivo fue evaluar nuevos marcadores para el estudio de la diversidad y la estructura genética intra-taxa de G intestinalis in silico y en ADN obtenido de muestras de heces. Analizamos nueve genes constitutivos en 80 secuencias completas del genoma y en un grupo de 24 muestras de heces de Colombia. Se evaluó la diversidad alélica por locus y para la secuencia concatenada de nueve loci que pudo discriminar hasta 53 alelos. Las reconstrucciones filogenéticas permitieron identificar los conjuntos AI, AII y B. Encontramos evidencias de eventos de recombinación intra e inter-ensamblaje. El análisis de la estructura de la población mostró una diferenciación genética entre los conjuntos analizados.