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Resultados de investigaciones

2019

The LUFS domain, its transcriptional regulator proteins, and drug resistance in the fungal pathogen Candida auris

Misas, E., Escandón, P., McEwen, J. G. & Clay, O. K., sep 10 2019, En : Protein Science. 28, 11, p. 2024-2029 6 p.

Resultado de la investigación: Contribución a una revistaArtículo

2018

Application of real-time PCR assays for the diagnosis of histoplasmosis using three molecular targets in human FFPE tissues and whole-blood

Título traducido de la contribución: Evaluación de un ensayo de flujo lateral de antígeno histoplasmático para el diagnóstico rápido de la histoplasmosis progresiva diseminada en pacientes con SIDA.López, L. F., Clay, O. K., Cáceres, D. H. & Gómez, B. L., jun 5 2018, p. S1-S159. 1 p.

Resultado de la investigación: Contribución a una conferenciaResumen

Acceso abierto

Conceptos de bioinformática de genomas para estudiar las micosis

Clay, O. K. & McEwen Ochoa, J. G., nov 15 2018, Fundamentos de las micosis humanas. González, Á., Gómez, B. L., Tobón, Á. M. & Restrepo, Á. (eds.). 1 ed. Colombia: CIB Fondo Editorial, Vol. 1. p. 657-677 21 p.

Resultado de la investigación: Capítulo en Libro/Reporte/ConferenciaCapítulo (revisado por pares)

Draft genome sequences of two Sporothrix schenckii clinical isolates associated with human sporotrichosis in Colombia

Título traducido de la contribución: Proyecto de secuencias genómicas de dos aislados clínicos de Sporothrix schenckii asociados con esporotricosis humana en ColombiaGomez, O. M., Alvarez, L. C., Muñoz, J. F., Misas, E., Gallo, J. E., Jimenez, M. D. P., Arango, M., McEwen, J. G., Hernandez, O. & Clay, O. K., jun 1 2018, En : Genome Announcements. 6, 24, e00495-18.

Resultado de la investigación: Contribución a una revistaArtículo

2 Citas (Scopus)

Genome analysis reveals evolutionary mechanisms of adaptation in systemic dimorphic fungi

Muñoz, J. F., McEwen, J. G., Clay, O. K. & Cuomo, C. A., dic 1 2018, En : Scientific Reports. 8, 1, 4473.

Resultado de la investigación: Contribución a una revistaArtículo

8 Citas (Scopus)
2017

Novel taxa of thermally dimorphic systemic pathogens in the Ajellomycetaceae (Onygenales)

Dukik, K., Muñoz, J. F., Jiang, Y., Feng, P., Sigler, L., Stielow, J. B., Freeke, J., Jamalian, A., Gerrits van den Ende, B., McEwen Ochoa, J. G., Clay, O. K., Schwartz, I. S., Govender, N. P., Maphanga, T. G., Cuomo, C. A., Moreno, L. F., Kenyon, C., Borman, A. M. & de Hoog, S., may 1 2017, En : Mycoses. 60, 5, p. 296-309 14 p.

Resultado de la investigación: Contribución a una revistaArtículo

51 Citas (Scopus)

Standardization and validation of real time PCR assays for the diagnosis of histoplasmosis using three molecular targets in an animal model

López, L. F., Muñoz, C. O., Cáceres, D. H., Tobón, Á. M., Loparev, V., Clay, O., Chiller, T., Litvintseva, A., Gade, L., González, Á. & Gómez, B. L., dic 29 2017, En : PLoS One. 12, 12, e0190311.

Resultado de la investigación: Contribución a una revistaArtículo

4 Citas (Scopus)
2016

From NGS assembly challenges to instability of fungal mitochondrial genomes: A case study in genome complexity

Misas, E., Muñoz, J. F., Gallo, J. E., McEwen, J. G. & Clay, O. K., abr 1 2016, En : Computational Biology and Chemistry. 61, p. 258-269 12 p.

Resultado de la investigación: Contribución a una revistaArtículo

1 Cita (Scopus)

Genome diversity, recombination, and virulence across the major lineages of Paracoccidioides

Muñoz, J. F., Farrer, R. A., Desjardins, C. A., Gallo, J. E., Sykes, S., Sakthikumar, S., Misas, E., Whiston, E. A., Bagagli, E., Soares, C. M. A., Teixeira, M. D. M., Taylor, J. W., Clay, O. K., McEwen, J. G. & Cuomo, C. A., sep 1 2016, En : mSphere. 1, 5, e00213-16.

Resultado de la investigación: Contribución a una revistaArtículo

Acceso abierto
35 Citas (Scopus)
2015

The Dynamic Genome and Transcriptome of the Human Fungal Pathogen Blastomyces and Close Relative Emmonsia

Muñoz, J. F., Gauthier, G. M., Desjardins, C. A., Gallo, J. E., Holder, J., Sullivan, T. D., Marty, A. J., Carmen, J. C., Chen, Z., Ding, L., Gujja, S., Magrini, V., Misas, E., Mitreva, M., Priest, M., Saif, S., Whiston, E. A., Young, S., Zeng, Q., Goldman, W. E. y 6 otros, Mardis, E. R., Taylor, J. W., McEwen, J. G., Clay, O. K., Klein, B. S. & Cuomo, C. A., ene 1 2015, En : PLoS Genetics. 11, 10, e1005493.

Resultado de la investigación: Contribución a una revistaArtículo

Acceso abierto
34 Citas (Scopus)
2014

Genome Update of the Dimorphic Human Pathogenic Fungi Causing Paracoccidioidomycosis

Muñoz, J. F., Gallo, J. E., Misas, E., Priest, M., Imamovic, A., Young, S., Zeng, Q., Clay, O. K., McEwen, J. G. & Cuomo, C. A., dic 4 2014, En : PLoS Neglected Tropical Diseases. 8, 12, e3348.

Resultado de la investigación: Contribución a una revistaArtículo

Acceso abierto
18 Citas (Scopus)

Limits to sequencing and de novo assembly: Classic benchmark sequences for optimizing fungal NGS designs

Muñnoz, J. F., Misas, E., Gallo, J. E., McEwen, J. G. & Clay, O. K., ene 1 2014, Advances in Computational Biology - Proceedings of the 2nd Colombian Congress on Computational Biology and Bioinformatics CCBCOL 2013. Springer, p. 221-230 10 p. (Advances in Intelligent Systems and Computing; vol. 232).

Resultado de la investigación: Capítulo en Libro/Reporte/ConferenciaContribución a la conferencia

2 Citas (Scopus)

The complex task of choosing a de novo assembly: Lessons from fungal genomes

Gallo, J. E., Muñoz, J. F., Misas, E., McEwen, J. G. & Clay, O. K., dic 2014, En : Computational Biology and Chemistry. 53, PA, p. 97-107 11 p.

Resultado de la investigación: Contribución a una revistaArtículo

3 Citas (Scopus)
2013

The eukaryotic genome, its reads, and the unfinished assembly

Muñoz, J. F., Gallo, J. E., Misas, E., McEwen, J. G. & Clay, O. K., jul 11 2013, En : FEBS Letters. 587, 14, p. 2090-2093 4 p.

Resultado de la investigación: Contribución a una revistaArtículo

3 Citas (Scopus)
2011

GC3 of genes can be used as a proxy for isochore base composition: A reply to Elhaik et al.

Clay, O. K. & Bernardi, G., ene 1 2011, En : Molecular Biology and Evolution. 28, 1, p. 21-23 3 p.

Resultado de la investigación: Contribución a una revistaArtículo de revisión

Acceso abierto
14 Citas (Scopus)