Facultad de Ciencias Naturales

2023

Balancing selection at a wing pattern locus is associated with major shifts in genome-wide patterns of diversity and gene flow

Rodriguez de Cara, M. Á., Jay, P., Rougemont, Q., Chouteau, M., Whibley, A., Huber, B., Piron-Prunier, F., Ramos, R. R., Freitas, A. V. L., Salazar, C., Silva-Brandão, K. L., Torres, T. T. & Joron, M., 2023, En: Peer Community Journal. 3, p. 1-18 18 p., e65.

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Balancing selection at a wing pattern locus is associated with major shifts in genome-wide patterns of diversity and gene flow

de Cara, M. Á. R., Jay, P., Rougemont, Q., Chouteau, M., Whibley, A., Huber, B., Piron-Prunier, F., Ramos, R. R., Freitas, A. V. L., Salazar, C., Silva-Brandão, K. L., Torres, T. T. & Joron, M., 2023, En: Peer Community Journal. 3, e65.

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Acceso abierto

Borrelia puertoricensis in opossums (Didelphis marsupialis) from Colombia

López, Y., Faccini-Martínez, Á. A., Muñoz-Leal, S., Contreras, V., Calderón, A., Rivero, R., Muñoz, M., Ramírez, J. D. & Mattar, S., dic. 2023, En: Parasites and Vectors. 16, 1, 448.

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Acceso abierto

2 Citas (Scopus)

Characterization of microbial communities in seven wetlands with different anthropogenic burden using Next Generation Sequencing in Bogotá, Colombia

Ballesteros, N., Páez, L., Luna, N., Reina, A., Urrea, V., Sánchez, C., Ramírez, A., Ramirez, J. D. & Muñoz, M., dic. 2023, En: Scientific Reports. 13, 1, 16973.

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Acceso abierto

3 Citas (Scopus)

Characterizing the blood microbiota of omnivorous and frugivorous bats (Chiroptera: Phyllostomidae) in Casanare, eastern Colombia

Luna, N., Muñoz, M., Castillo-Castañeda, A., Hernandez, C., Urbano, P., Shaban, M., Paniz-Mondolfi, A. & Ramírez, J. D., 2023, En: PeerJ. 11, 15169.

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Acceso abierto

1 Cita (Scopus)

Characterizing viral species in mosquitoes (Culicidae) in the Colombian Orinoco: insights from a preliminary metagenomic study

Gómez, M., Martínez, D., Páez-Triana, L., Luna, N., De las salas, J. L., Hernández, C., Flórez, A. Z., Muñoz, M. & Ramírez, J. D., dic. 2023, En: Scientific Reports. 13, 1, 22081.

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Acceso abierto

Clinical performance of a quantitative pan-genus Leishmania Real-time PCR assay for diagnosis of cutaneous and visceral leishmaniasis

Ramírez, J. D., Cao, L., Castillo-Castañeda, A. C., Patino, L. H., Ayala, M. S., Cordon-Cardo, C., Sordillo, E. M. & Paniz-Mondolfi, A., nov. 2023, En: Practical Laboratory Medicine. 37, e00341.

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Acceso abierto

2 Citas (Scopus)

Cold waves still matter: characteristics and associated climatic signals in Europe

Quesada, B., Vautard, R. & Yiou, P., ene. 2023, En: Climatic Change. 176, 6, 70.

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Acceso abierto

5 Citas (Scopus)

Connecting the multiple dimensions of global soil fungal diversity

Mikryukov, V., Dulya, O., Zizka, A., Bahram, M., Hagh-Doust, N., Anslan, S., Prylutskyi, O., Delgado-Baquerizo, M., Maestre, F. T., Nilsson, H., Pärn, J., Öpik, M., Moora, M., Zobel, M., Espenberg, M., Mander, Ü., Khalid, A. N., Corrales, A., Agan, A., Vasco-Palacios, A. M., y 86 otrosSaitta, A., Rinaldi, A., Verbeken, A., Sulistyo, B., Tamgnoue, B., Furneaux, B., Duarte Ritter, C., Nyamukondiwa, C., Sharp, C., Marín, C., Gohar, D., Klavina, D., Sharmah, D., Dai, D. Q., Nouhra, E., Biersma, E. M., Rähn, E., Cameron, E., De Crop, E., Otsing, E., Davydov, E., Albornoz, F., Brearley, F., Buegger, F., Zahn, G., Bonito, G., Hiiesalu, I., Barrio, I., Heilmann-Clausen, J., Ankuda, J., Doležal, J., Kupagme, J., Maciá-Vicente, J., Djeugap Fovo, J., Geml, J., Alatalo, J., Alvarez-Manjarrez, J., Põldmaa, K., Runnel, K., Adamson, K., Bråthen, K. A., Pritsch, K., Tchan Issifou, K., Armolaitis, K., Hyde, K., Newsham, K. K., Panksep, K., Lateef, A. A., Hansson, L., Lamit, L., Saba, M., Tuomi, M., Gryzenhout, M., Bauters, M., Piepenbring, M., Wijayawardene, N. N., Yorou, N., Kurina, O., Mortimer, P., Meidl, P., Kohout, P., Puusepp, R., Drenkhan, R., Garibay-Orijel, R., Godoy, R., Alkahtani, S., Rahimlou, S., Dudov, S., Põlme, S., Ghosh, S., Mundra, S., Ahmed, T., Netherway, T., Henkel, T., Roslin, T., Nteziryayo, V., Fedosov, V., Onipchenko, V., Yasanthika, W. A. E., Lim, Y., Van Nuland, M., Soudzilovskaia, N., Antonelli, A., Kõljalg, U., Abarenkov, K. & Tedersoo, L., dic. 1 2023, En: Science advances. 9, 48, p. eadj8016

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9 Citas (Scopus)

Correction to: Cold waves still matter: characteristics and associated climatic signals in Europe (Climatic Change, (2023), 176, 6, (70), 10.1007/s10584-023-03533-0)

Quesada, B., Vautard, R. & Yiou, P., jul. 2023, En: Climatic Change. 176, 7, 86.

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Daily dataset of precipitation and temperature in the Department of Cauca, Colombia

Blanco, K., Villamizar, S. R., Avila-Diaz, A., Marceló-Díaz, C., Santamaría, E. & Lesmes, M. C., oct. 2023, En: Data in Brief. 50, 109542.

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Acceso abierto

2 Citas (Scopus)

Description of pathogenic bacteria in patients with respiratory symptoms associated with severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) in Colombia

Zuluaga, N., Martínez, D., Hernández, C., Ballesteros, N., Castañeda, S., Ramírez, J. D. & Muñoz, M., dic. 2023, En: Annals of Clinical Microbiology and Antimicrobials. 22, 1, 56.

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Acceso abierto

4 Citas (Scopus)

Diet-induced changes in fecal microbiota composition and diversity in dogs (Canis lupus familiaris): A comparative study of BARF-type and commercial diets

Castañeda, S., Ariza, G., Rincón-Riveros, A., Muñoz, M. & Ramírez, J. D., jul. 2023, En: Comparative Immunology, Microbiology and Infectious Diseases. 98, 102007.

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4 Citas (Scopus)

Differential expression of meiosis and homologous recombination-related genes in the life cycle of Trypanosoma cruzi

Cruz-Saavedra, L., Caceres, T., Ballesteros, N., Posada-Forero, B. & Ramírez, J. D., ago. 2023, En: Parasitology Research. 122, 8, p. 1747-1757 11 p.

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Dirofilaria immitis in pet dogs from the metropolitan area of the Colombian Caribbean

Badillo-Viloria, M. A., García-Bocanegra, I., de Lavalle-Galvis, R. J., Martínez, R., de la Rosa-Jaramillo, S., Castillo-Castañeda, A., Ramírez, J. D. & Cano-Terriza, D., nov. 2023, En: Comparative Immunology, Microbiology and Infectious Diseases. 102, 102064.

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1 Cita (Scopus)

Distribution of the northern pampas cat, Leopardus garleppi, in northern South America, confirmation of its presence in Colombia and genetic analysis of a controversial record from the country

Astorquiza, J. M., Noguera-Urbano, E. A., Cabrera-Ojeda, C., Cepeda-Quilindo, B., González-Maya, J. F., Eizirik, E., Bonilla-Sánchez, A., Buitrago, D. L., Pulido-Santacruz, P. & Ramírez-Chaves, H. E., 2023, (En prensa) En: Mammalia.

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Diversity and geographical distribution of Leishmania species and the emergence of Leishmania (Leishmania) infantum and L. (Viannia) panamensis in Central-Western Venezuela

Delgado-Noguera, L. A., Hernández-Pereira, C. E., Castillo-Castañeda, A. C., Patiño, L. H., Castañeda, S., Herrera, G., Mogollón, E., Muñoz, M., Duran, A., Loyo, D., Pacheco, M., Arena, L., Isquiel, G., Yepez, L., Colmenarez, B., Caviedes, M., Mendez, Y., Herrera, S., Ramírez, J. D. & Paniz-Mondolfi, A. E., jun. 2023, En: Acta Tropica. 242, 106901.

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3 Citas (Scopus)

Does sexual conflict contribute to the evolution of novel warning patterns?

Título traducido de la contribución: Does sexual conflict contribute to the evolution of novel warning patterns?Hausmann, A. E., Freire, M., Alfthan, S. A., Kuo, C-Y., Linares, M., McMillan, O., Pardo-Diaz, C., Salazar, C. & Merrill, R. M., mar. 2023, En: Journal of Evolutionary Biology. 36, 3, p. 563-578 16 p.

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2 Citas (Scopus)

Draft genomes of Blastocystis subtypes from human samples of Colombia

Higuera, A., Salas-Leiva, D. E., Curtis, B., Patiño, L. H., Zhao, D., Jerlström-Hultqvist, J., Dlutek, M., Muñoz, M., Roger, A. J. & Ramírez, J. D., dic. 2023, En: Parasites and Vectors. 16, 1, 52.

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Acceso abierto

4 Citas (Scopus)

Drainage and sedimentary response of the Northern Andes and the Pebas system to Miocene strike-slip tectonics: A source to sink study of the Magdalena Basin

Zapata Henao, S., abr. 17 2023, En: Basin Research.

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12 Citas (Scopus)

Ecological interactions of sand flies, hosts, and Leishmania panamensis in an endemic area of cutaneous leishmaniasis in Colombia

Posada-López, L., Velez-Mira, A., Cantillo, O., Castillo-Castañeda, A., Ramírez, J. D., Galati, E. A. B. & Galvis-Ovallos, F., may. 2023, En: PLoS Neglected Tropical Diseases. 17, 5, e0011316.

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Acceso abierto

2 Citas (Scopus)

Effects of exercise and physical activity on gut microbiota composition and function in older adults: a systematic review

Aya, V., Jimenez, P., Muñoz, E. & Ramírez, J. D., dic. 2023, En: BMC Geriatrics. 23, 1, 364.

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Acceso abierto

7 Citas (Scopus)

Effects of urban, peri-urban and rural land covers on plant functional traits around Bogotá, Colombia

Salamanca-Fonseca, M., Aldana, A. M., Vargas-Martinez, V., Acero-Gomez, S., Fonseca-Tellez, J., Gutierrez, S., Hoyos, Y. D., León, K. M., Márquez, C., Molina-R, L., Moreno-Abdelnur, A., Pineda, S., Pinzón, J. J., Trespalacios, M., Velasco, L., Sanchez-Tello, J. D., Alvarez-Garzón, C., Posada, J. M. & Sanchez, A., 2023, (En prensa) En: Urban Ecosystems.

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Acceso abierto

4 Citas (Scopus)

Employing oxford nanopore technologies (ONT) for understanding the ecology and transmission dynamics of flaviviruses in mosquitoes (Diptera: Culicidae) from Eastern Colombia

Martínez, D., Gómez, M., De las salas, J. L., Hernández, C., Flórez, A. Z., Muñoz, M. & Ramírez, J. D., sep. 2023, En: Acta Tropica. 245, 106972.

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1 Cita (Scopus)

Epidemiological features of Leishmania infantum in dogs (Canis lupus familiaris) suggest a latent risk of visceral leishmaniasis in the metropolitan area of Bucaramanga, Santander, Eastern Colombia

Jaimes-Dueñez, J., Castillo-Castañeda, A., Jiménez-Leaño, Á., Duque, J. E., Cantillo-Barraza, O., Cáceres-Rivera, D. I., Granada, Y., Triana-Chávez, O. & Ramírez, J. D., oct. 2023, En: Preventive Veterinary Medicine. 219, 106021.

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Evaluation and validation of an RT-PCR assay for specific detection of monkeypox virus (MPXV)

Paniz-Mondolfi, A., Guerra, S., Muñoz, M., Luna, N., Hernandez, M. M., Patino, L. H., Reidy, J., Banu, R., Shrestha, P., Liggayu, B., Umeaku, A., Chen, F., Cao, L., Patel, A., Hanna, A., Li, S., Look, A., Pagani, N., Albrecht, R., Pearl, R., y 24 otrosGarcia-Sastre, A., Bogunovic, D., Palacios, G., Bonnier, L., Cera, F., Lopez, H., Calderon, Y., Eiting, E., Mullen, K., Shin, S. J., Lugo, L. A., Urbina, A. E., Starks, C., Koo, T., Uychiat, P., Look, A., van Bakel, H., Gonzalez-Reiche, A., Betancourt, A. F., Reich, D., Cordon-Cardo, C., Simon, V., Sordillo, E. M. & Ramírez, J. D., oct. 19 2023, En: Journal of Medical Virology. 95, 1, e28247.

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Acceso abierto

30 Citas (Scopus)

Examining the gut microbiota from several human-biting tick species in Northwestern Spain

Herrera, G., Vieira Lista, M. C., Páez-Triana, L., Muro, A., López-Abán, J., Muñoz, M. & Ramírez, J. D., sep. 1 2023, En: Journal of Medical Entomology. 60, 5, p. 1081-1087 7 p.

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Extensive Phylogenomic Discordance and the Complex Evolutionary History of the Neotropical Cat Genus Leopardus

Lescroart, J., Bonilla-Sánchez, A., Napolitano, C., Buitrago-Torres, D. L., Ramírez-Chaves, H. E., Pulido-Santacruz, P., Murphy, W. J., Svardal, H. & Eizirik, E., dic. 1 2023, En: Molecular Biology and Evolution. 40, 12, msad255.

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2 Citas (Scopus)

Genomic and ultrastructural analysis of monkeypox virus in skin lesions and in human/animal infected cells reveals further morphofunctional insights into viral pathogenicity

Paniz-Mondolfi, A., Reidy, J., Pagani, N., Lednicky, J. A., McGrail, J. P., Kasminskaya, Y., Patino, L. H., Garcia-Sastre, A., Palacios, G., Gonzalez-Reiche, A. S., van Bakel, H., Firpo Betancourt, A., Hernandez, M. M., Cordon-Cardo, C., Simon, V., Sordillo, E. M., Ramírez, J. D. & Guerra, S., jun. 2023, En: Journal of Medical Virology. 95, 6, e28878.

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5 Citas (Scopus)

Genomic epidemiology of SARS-CoV-2 variants during the first two years of the pandemic in Colombia

Jimenez-Silva, C., Rivero, R., Douglas, J., Bouckaert, R., Villabona-Arenas, C. J., Atkins, K. E., Gastelbondo, B., Calderon, A., Guzman, C., Echeverri-De la Hoz, D., Muñoz, M., Ballesteros, N., Castañeda, S., Patiño, L. H., Ramirez, A., Luna, N., Paniz-Mondolfi, A., Serrano-Coll, H., Ramirez, J. D., Mattar, S., y 1 otrosDrummond, A. J., dic. 2023, En: Communications Medicine. 3, 1, 97.

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Acceso abierto

5 Citas (Scopus)

Geography shapes the microbial community in Heliconius butterflies

Luna, N., Herrera, G., Muñoz, M., Sánchez-Herrera, M., Brown, A., Khazan, E., Pardo-Diaz, C., Ramírez, J. D. & Salazar, C., mar. 23 2023, En: FEMS Microbiology Ecology. 99, 4

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Group-level differences in social network structure remain repeatable after accounting for environmental drivers

Título traducido de la contribución: Diferencias grupales en la estructura social permanecen en repetidles después de controlar factores ambientalesOgino, M., Maldonado-Chaparro, A. A., Aplin, L. M. & Farine, D. R., jul. 19 2023, En: Royal Society Open Science. 10, 7, p. 230-340 11 p.

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Acceso abierto

4 Citas (Scopus)

How to fill the biodiversity data gap: Is it better to invest in fieldwork or curation?

Vargas, C. A., Bottin, M., Sarkinen, T., Richardson, J. E., Celis, M., Villanueva, B. & Sanchez, A., 2023, (En prensa) En: Plant Diversity.

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Acceso abierto

3 Citas (Scopus)

Impact of Intermittent Fasting on the Gut Microbiota: A Systematic Review

Pérez-Gerdel, T., Camargo, M., Alvarado, M. & Ramírez, J. D., ago. 2023, En: Advanced Biology. 7, 8, 2200337.

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2 Citas (Scopus)

La respuesta inmune de algunas especies del género Rhodnius modifica la circulación de genotipos de Trypanosoma cruzi y T. rangeli en varias regiones de América Latina

Vallejo, G. A., Barbosa, H. J., Suarez, Y., Meneses, A., Carranza, J. C., Urrea, D. A., Guhl, F., Hernández, D. C. & Ramírez, J. D., dic. 20 2023, En: Revista de la Academia Colombiana de Ciencias Exactas, Fisicas y Naturales. 47, 185, p. 765-784 20 p.

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Acceso abierto

1 Cita (Scopus)

Metagenomic exploration of endosymbionts and pathogens in the tropical lineage of Rhipicephalus sanguineus sensu lato (s.l.) ticks in Colombia

Paez-Triana, L., Herrera, G., Vega, L., García-Corredor, D., Medellín, M. O. P., Paniz-Mondolfi, A., Muñoz, M. & Ramírez, J. D., 2023, En: Metabarcoding and Metagenomics. 7, p. 273-304 32 p.

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Acceso abierto

1 Cita (Scopus)

Microbiome Alterations Driven by Trypanosoma cruzi Infection in Two Disjunctive Murine Models

Castañeda, S., Muñoz, M., Hotez, P. J., Bottazzi, M. E., Paniz-Mondolfi, A. E., Jones, K. M., Mejia, R., Poveda, C. & Ramírez, J. D., may. 2023, En: Microbiology spectrum. 11, 3

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Acceso abierto

3 Citas (Scopus)

Miocene paleogeography of northwest Colombia: A review of the sedimentary and magmatic evolution of the Amagá Basin a century after Grosse’s work

Título traducido de la contribución: Paleogeografía del Mioceno en el noroccidente de Colombia: una revisión de la evolución sedimentaria y magmática de la cuenca de Amagá un siglo después del trabajo de GrosseZapata, S., Jaramillo-Ríos, J. S., Botello, G. E., Siachoque, A., Calderon-Díaz, L. C., Cardona, A., Till, C. & Valencia, V., dic. 20 2023, En: Revista de la Academia Colombiana de Ciencias Exactas, Fisicas y Naturales. 47, 185, p. 904-924 21 p.

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Acceso abierto

1 Cita (Scopus)

Miocene Paleogeography of NW Colombia: A review of the sedimentary and magmatic evolution of the Amagá Basin a century after Grosse’s work

Zapata Henao, S., Jaramillo-Rios, J. S., Botello, G. E., Siachoque, A., Calderon-Dia, L. C., Cardona, A., Till, C. & Valencia, V., 2023, En: Revista de la Academia Colombiana de Ciencias Exactas, Fisicas y Naturales.

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Molecular characterization of Fasciola hepatica in endemic regions of Colombia

Garcia-Corredor, D., Alvarado, M., Pulido-Medellín, M., Muñoz, M., Cruz-Saavedra, L., Hernández, C., Giraldo, J. C., Vásquez-Arteaga, L. R., Morillo Coronado, A. C. & Ramírez, J. D., 2023, En: Frontiers in Veterinary Science. 10, 1171147.

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Acceso abierto

2 Citas (Scopus)

Molecular detection and characterization of Giardia spp., Cryptosporidium spp., and Blastocystis in captive wild animals rescued from central Colombia

Cruz-Saavedra, L., Arévalo, V. A., Garcia-Corredor, D., Jiménez, P. A., Vega, L., Pulido-Medellín, M., Ortiz-Pineda, M. & Ramírez, J. D., dic. 2023, En: International Journal for Parasitology: Parasites and Wildlife. 22, p. 1-5 5 p.

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Acceso abierto

3 Citas (Scopus)

Molecular Detection of Candida auris Using DiaSorin Molecular Simplexa^® Detection Kit: A Diagnostic Performance Evaluation

Ramírez, J. D., Wang, C. Y., Bolton, D., Liggayu, B., Schaefer, S., Patel, G., Javaid, W., Cordon-Cardo, C., Firpo-Betancourt, A., Sordillo, E. M. & Paniz-Mondolfi, A., ago. 2023, En: Journal of Fungi. 9, 8, 849.

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Acceso abierto

3 Citas (Scopus)

Molecular evidence of Borrelia spp. in bats from Córdoba Department, northwest Colombia

Título traducido de la contribución: Evidencia molecular de Borrelia spp. en murciélagos del Departamento de Córdoba, noroeste de ColombiaLópez, Y., Muñoz-Leal, S., Martínez, C., Guzmán, C., Calderón, A., Martínez, J., Galeano, K., Muñoz, M., Ramírez, J. D., Faccini-Martínez, Á. A. & Mattar, S., dic. 2023, En: Parasites and Vectors. 16, 1, 5.

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Acceso abierto

2 Citas (Scopus)

Monkeypox virus (MPXV) genomics: A mutational and phylogenomic analyses of B.1 lineages

Luna, N., Muñoz, M., Bonilla-Aldana, D. K., Patiño, L. H., Kasminskaya, Y., Paniz-Mondolfi, A. & Ramírez, J. D., mar. 1 2023, En: Travel Medicine and Infectious Disease. 52, 102551.

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Acceso abierto

25 Citas (Scopus)

Mpox vaccine and infection-driven human immune signatures: an immunological analysis of an observational study

PVI study group, nov. 2023, En: The Lancet Infectious Diseases. 23, 11, p. 1302-1312 11 p.

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27 Citas (Scopus)

Multi-decadal trends and variability in burned area from the fifth version of the Global Fire Emissions Database (GFED5)

Chen, Y., Hall, J., Van Wees, D., Andela, N., Hantson, S., Giglio, L., Van Der Werf, G. R., Morton, D. C. & Randerson, J. T., nov. 28 2023, En: Earth System Science Data. 15, 11, p. 5227-5259 33 p.

Producción científica: Contribución a una revista › Artículo de Investigación › revisión exhaustiva

Acceso abierto

21 Citas (Scopus)

Mu SARS-CoV-2 (B.1.621) variant: A genomic snapshot across the Colombian-Venezuelan border

Patiño, L. H., Ballesteros, N., Muñoz, M., Ramírez, A. L., Luna, N., Castañeda, S., Gutierrez-Marin, R., Mendoza-Ibarra, J. A., Rodriguez, R., Bohada, D. P., Ramírez, J. D. & Paniz-Mondolfi, A., abr. 2023, En: Journal of Medical Virology. 95, 4, e28766.

Producción científica: Contribución a una revista › Carta › revisión exhaustiva

Acceso abierto

Nanotecnología aplicada a la sensibilización tumoral: una aproximación a la nanomedicina

López, G., Ramírez Prieto, J., Rodriguez Burbano, D. C. & Ondo Mendez, A. O., oct. 26 2023.

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New insights into the fossil record of the turtle genus Chelus Duméril, 1806 including new specimens with information on cervicals and limb bones

Cadena, E. A., Link, A., Vanegas, A., Avellaneda-Otero, C. A., Perdomo, C., Urueña-Carrillo, D. A., Sánchez, R., Vanegas, R., Scheyer, T. M. & Carrillo-Briceño, J. D., 2023, En: Comptes Rendus - Palevol. 22, p. 689-709 21 p.

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1 Cita (Scopus)

Parallel evolution of behavior, physiology, and life history associated with altitudinal shifts in forest type in Heliconius butterflies

Rivas-Sánchez, D. F., Melo-Flórez, L., Aragón, A., Pardo-Díaz, C., Salazar, C., Montgomery, S. H. & Merrill, R. M., jun. 1 2023, En: Evolution; international journal of organic evolution. 77, 6, p. 1458-1467 10 p.

Producción científica: Contribución a una revista › Artículo de Investigación › revisión exhaustiva

2 Citas (Scopus)

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