Genetic Polymorphisms in Cytokine Genes in Colombian Patients with Ocular Toxoplasmosis

Ligia Alejandra Delatorre Cifuentes, carlos andres Naranjo Galvis, Daniel Stiven Marin Medina , Jorge Enrique Gómez Marin , Juan Pablo Orozco Hernández

Research output: Contribution to journalArticle

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Abstract

Toxoplasmosis is caused by infection with the protozoan parasite Toxoplasma
gondii, which has the capacity to infect all warm-blooded animals worldwide.
Toxoplasmosis is a major cause of visual defects in the Colombian population; however,
the association between genetic polymorphisms in cytokine genes and susceptibility
to ocular toxoplasmosis has not been studied in this population. This work
evaluates the associations between polymorphisms in genes coding for the cytokines
tumor necrosis factor alpha (TNF-) (rs1799964, rs1800629, rs1799724, rs1800630,
and rs361525), interleukin 1 (IL-1) (rs16944, rs1143634, and rs1143627), IL-1
(rs1800587), gamma interferon (IFN-) (rs2430561), and IL-10 (rs1800896 and rs1800871)
and the presence of ocular toxoplasmosis (OT) in a sample of a Colombian population
(61 patients with OT and 116 healthy controls). Genotyping was performed with
the “dideoxynucleotide (ddNTP) primer extension” technique. Functional-effect predictions
of single nucleotide polymorphisms (SNPs) were done by using FuncPred. A
polymorphism in the IL-10 gene promoter (1082G/A) was significantly more prevalent
in OT patients than in controls (P 1.93e08; odds ratio [OR] 5.27e03; 95% confidence
interval [CI] 3.18 to 8.739; Bonferroni correction [BONF] 3.48e07). In contrast,
haplotype “AG” of the IL-10 gene promoter polymorphisms (rs1800896 and
rs1800871) was present at a lower frequency in OT patients (P 7e04; OR 0.10;
95% CI 0.03 to 0.35). The 874A/T polymorphism of IFN- was associated with OT
(P 3.37e05; OR 4.2; 95% CI 2.478 to 7.12; BONF 6.07e04). Haplotype “GAG”
of the IL-1 gene promoter polymorphisms (rs1143634, rs1143627, and rs16944) appeared
to be significantly associated with OT (P 0.0494). The IL-10, IFN-, and IL-1
polymorphisms influence the development of OT in the Colombian population
Original languageEnglish
Pages (from-to)1/16
Number of pages16
JournalInfection and Immunity
Volume86
DOIs
StatePublished - Feb 5 2018

Cite this

Delatorre Cifuentes, L. A., Naranjo Galvis, C. A., Marin Medina , D. S., Gómez Marin , J. E., & Orozco Hernández , J. P. (2018). Genetic Polymorphisms in Cytokine Genes in Colombian Patients with Ocular Toxoplasmosis. Infection and Immunity, 86, 1/16. https://doi.org/10.1128/IAI.00597-17
Delatorre Cifuentes, Ligia Alejandra ; Naranjo Galvis, carlos andres ; Marin Medina , Daniel Stiven ; Gómez Marin , Jorge Enrique ; Orozco Hernández , Juan Pablo . / Genetic Polymorphisms in Cytokine Genes in Colombian Patients with Ocular Toxoplasmosis. In: Infection and Immunity. 2018 ; Vol. 86. pp. 1/16.
@article{0d0a9727489d4a5e990307437202c2f9,
title = "Genetic Polymorphisms in Cytokine Genes in Colombian Patients with Ocular Toxoplasmosis",
abstract = "La toxoplasmosis es causada por una infecci{\'o}n con el par{\'a}sito protozoario Toxoplasmagondii, que tiene la capacidad de infectar a todos los animales de sangre caliente de todo el mundo.La toxoplasmosis es una causa importante de defectos visuales en la poblaci{\'o}n colombiana; sin embargo,la asociaci{\'o}n entre polimorfismos gen{\'e}ticos en genes de citocinas y susceptibilidada la toxoplasmosis ocular no se ha estudiado en esta poblaci{\'o}n. Este trabajoeval{\'u}a las asociaciones entre polimorfismos en genes que codifican las citoquinasfactor de necrosis tumoral alfa (TNF-) (rs1799964, rs1800629, rs1799724, rs1800630,y rs361525), interleucina 1 (IL-1) (rs16944, rs1143634 y rs1143627), IL-1(rs1800587), interfer{\'o}n gamma (IFN-) (rs2430561) e IL-10 (rs1800896 y rs1800871)y la presencia de toxoplasmosis ocular (TO) en una muestra de una poblaci{\'o}n colombiana(61 pacientes con OT y 116 controles sanos). La genotipificaci{\'o}n se realiz{\'o} conla t{\'e}cnica de {"}extensi{\'o}n de cebador didesoxinucle{\'o}tido (ddNTP){"}. Predicciones de efectos funcionalesde polimorfismos de un solo nucle{\'o}tido (SNP) se realizaron mediante el uso de FuncPred. UNpolimorfismo en el promotor del gen IL-10 (1082G / A) fue significativamente m{\'a}s frecuenteen pacientes con OT que en controles (P 1.93e08; odds ratio [OR] 5.27e03; 95{\%} de confianzaintervalo [IC] 3,18 a 8,739; Correcci{\'o}n de Bonferroni [BONF] 3.48e07). A diferencia de,haplotipo {"}AG{"} de los polimorfismos del promotor del gen IL-10 (rs1800896 yrs1800871) estaba presente a una frecuencia m{\'a}s baja en pacientes con OT (P 7e04; OR 0,10;IC del 95{\%}: 0,03 a 0,35). El polimorfismo 874A / T de IFN- se asoci{\'o} con OT(P 3,37e05; O 4,2; IC del 95{\%}: 2,478 a 7,12; BONF 6,07e04). Haplotipo {"}GAG{"}de los polimorfismos del promotor del gen IL-1 (rs1143634, rs1143627 y rs16944) aparecieronestar significativamente asociado con OT (P 0.0494). El IL-10, IFN- e IL-1polimorfismos influyen en el desarrollo de OT en la poblaci{\'o}n colombiana",
author = "{Delatorre Cifuentes}, {Ligia Alejandra} and {Naranjo Galvis}, {carlos andres} and {Marin Medina}, {Daniel Stiven} and {G{\'o}mez Marin}, {Jorge Enrique} and {Orozco Hern{\'a}ndez}, {Juan Pablo}",
year = "2018",
month = "2",
day = "5",
doi = "10.1128/IAI.00597-17",
language = "Ingl{\'e}s",
volume = "86",
pages = "1/16",
journal = "Infection and Immunity",
issn = "0019-9567",
publisher = "American Society for Microbiology",

}

Delatorre Cifuentes, LA, Naranjo Galvis, CA, Marin Medina , DS, Gómez Marin , JE & Orozco Hernández , JP 2018, 'Genetic Polymorphisms in Cytokine Genes in Colombian Patients with Ocular Toxoplasmosis', Infection and Immunity, vol. 86, pp. 1/16. https://doi.org/10.1128/IAI.00597-17

Genetic Polymorphisms in Cytokine Genes in Colombian Patients with Ocular Toxoplasmosis. / Delatorre Cifuentes, Ligia Alejandra; Naranjo Galvis, carlos andres ; Marin Medina , Daniel Stiven ; Gómez Marin , Jorge Enrique; Orozco Hernández , Juan Pablo .

In: Infection and Immunity, Vol. 86, 05.02.2018, p. 1/16.

Research output: Contribution to journalArticle

TY - JOUR

T1 - Genetic Polymorphisms in Cytokine Genes in Colombian Patients with Ocular Toxoplasmosis

AU - Delatorre Cifuentes, Ligia Alejandra

AU - Naranjo Galvis, carlos andres

AU - Marin Medina , Daniel Stiven

AU - Gómez Marin , Jorge Enrique

AU - Orozco Hernández , Juan Pablo

PY - 2018/2/5

Y1 - 2018/2/5

N2 - La toxoplasmosis es causada por una infección con el parásito protozoario Toxoplasmagondii, que tiene la capacidad de infectar a todos los animales de sangre caliente de todo el mundo.La toxoplasmosis es una causa importante de defectos visuales en la población colombiana; sin embargo,la asociación entre polimorfismos genéticos en genes de citocinas y susceptibilidada la toxoplasmosis ocular no se ha estudiado en esta población. Este trabajoevalúa las asociaciones entre polimorfismos en genes que codifican las citoquinasfactor de necrosis tumoral alfa (TNF-) (rs1799964, rs1800629, rs1799724, rs1800630,y rs361525), interleucina 1 (IL-1) (rs16944, rs1143634 y rs1143627), IL-1(rs1800587), interferón gamma (IFN-) (rs2430561) e IL-10 (rs1800896 y rs1800871)y la presencia de toxoplasmosis ocular (TO) en una muestra de una población colombiana(61 pacientes con OT y 116 controles sanos). La genotipificación se realizó conla técnica de "extensión de cebador didesoxinucleótido (ddNTP)". Predicciones de efectos funcionalesde polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) se realizaron mediante el uso de FuncPred. UNpolimorfismo en el promotor del gen IL-10 (1082G / A) fue significativamente más frecuenteen pacientes con OT que en controles (P 1.93e08; odds ratio [OR] 5.27e03; 95% de confianzaintervalo [IC] 3,18 a 8,739; Corrección de Bonferroni [BONF] 3.48e07). A diferencia de,haplotipo "AG" de los polimorfismos del promotor del gen IL-10 (rs1800896 yrs1800871) estaba presente a una frecuencia más baja en pacientes con OT (P 7e04; OR 0,10;IC del 95%: 0,03 a 0,35). El polimorfismo 874A / T de IFN- se asoció con OT(P 3,37e05; O 4,2; IC del 95%: 2,478 a 7,12; BONF 6,07e04). Haplotipo "GAG"de los polimorfismos del promotor del gen IL-1 (rs1143634, rs1143627 y rs16944) aparecieronestar significativamente asociado con OT (P 0.0494). El IL-10, IFN- e IL-1polimorfismos influyen en el desarrollo de OT en la población colombiana

AB - La toxoplasmosis es causada por una infección con el parásito protozoario Toxoplasmagondii, que tiene la capacidad de infectar a todos los animales de sangre caliente de todo el mundo.La toxoplasmosis es una causa importante de defectos visuales en la población colombiana; sin embargo,la asociación entre polimorfismos genéticos en genes de citocinas y susceptibilidada la toxoplasmosis ocular no se ha estudiado en esta población. Este trabajoevalúa las asociaciones entre polimorfismos en genes que codifican las citoquinasfactor de necrosis tumoral alfa (TNF-) (rs1799964, rs1800629, rs1799724, rs1800630,y rs361525), interleucina 1 (IL-1) (rs16944, rs1143634 y rs1143627), IL-1(rs1800587), interferón gamma (IFN-) (rs2430561) e IL-10 (rs1800896 y rs1800871)y la presencia de toxoplasmosis ocular (TO) en una muestra de una población colombiana(61 pacientes con OT y 116 controles sanos). La genotipificación se realizó conla técnica de "extensión de cebador didesoxinucleótido (ddNTP)". Predicciones de efectos funcionalesde polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) se realizaron mediante el uso de FuncPred. UNpolimorfismo en el promotor del gen IL-10 (1082G / A) fue significativamente más frecuenteen pacientes con OT que en controles (P 1.93e08; odds ratio [OR] 5.27e03; 95% de confianzaintervalo [IC] 3,18 a 8,739; Corrección de Bonferroni [BONF] 3.48e07). A diferencia de,haplotipo "AG" de los polimorfismos del promotor del gen IL-10 (rs1800896 yrs1800871) estaba presente a una frecuencia más baja en pacientes con OT (P 7e04; OR 0,10;IC del 95%: 0,03 a 0,35). El polimorfismo 874A / T de IFN- se asoció con OT(P 3,37e05; O 4,2; IC del 95%: 2,478 a 7,12; BONF 6,07e04). Haplotipo "GAG"de los polimorfismos del promotor del gen IL-1 (rs1143634, rs1143627 y rs16944) aparecieronestar significativamente asociado con OT (P 0.0494). El IL-10, IFN- e IL-1polimorfismos influyen en el desarrollo de OT en la población colombiana

U2 - 10.1128/IAI.00597-17

DO - 10.1128/IAI.00597-17

M3 - Artículo

C2 - 29426041

VL - 86

SP - 1/16

JO - Infection and Immunity

JF - Infection and Immunity

SN - 0019-9567

ER -