Expression of the Major and Pro-Oncogenic H3K9 Lysine Methyltransferase SETDB1 in Non-Small Cell Lung Cancer

S.R. Ramírez, Paola Andrea Cruz Tapias, Vlada Zakharova, Slimane Ait-Si-Ali, Oscar M. Perez-Fernandez, William Mantilla

Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

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Abstract

SETDB1 is a key histone lysine methyltransferase involved in gene silencing. The SETDB1 gene is amplified in human lung cancer, where the protein plays a driver role. Here, we investigated the clinical significance of SETDB1 expression in the two major forms of human non-small cell lung carcinoma (NSCLC), i.e., adenocarcinoma (ADC) and squamous cell carcinoma (SCC), by combining a meta-analysis of transcriptomic datasets and a systematic review of the literature. A total of 1140 NSCLC patients and 952 controls were included in the association analyses. Our data revealed higher levels of SETDB1 mRNA in ADC (standardized mean dierence, SMD: 0.88; 95% confidence interval, CI: 0.73–1.02; p < 0.001) and SCC (SMD: 0.40; 95% CI: 0.13–0.66; p = 0.003) compared to non-cancerous tissues. For clinicopathological analyses, 2533 ADC and 903 SCC patients were included. Interestingly, SETDB1 mRNA level was increased in NSCLC patients who were current smokers compared to non-smokers (SMD: 0.26; 95% CI: 0.08–0.44; p = 0.004), and when comparing former smokers and non-smokers (p = 0.009). Furthermore, the area under the curve (AUC) given by the summary receiver operator characteristic curve (sROC) was 0.774 (Q = 0.713). Together, our findings suggest a strong foundation for further research to evaluate SETDB1 as a diagnostic biomarker and/or its potential use as a therapeutic target in NSCLC. SETDB1 es una histona lisina metiltransferasa que participa en el silenciamiento de la expresión fr varios genes. Se ha reportado que el gen SETDB1 puede estar amplificado en el cáncer de pulmón humano, donde la proteína juega un papel importante. Aquí, investigamos la importancia clínica de la expresión de SETDB1 en las dos formas principales de carcinoma de pulmón de células no pequeñas humanas (NSCLC), es decir, adenocarcinoma (ADC) y carcinoma de células escamosas (SCC), combinando un metaanálisis de conjuntos de datos transcriptómicos y una revisión sistemática de la literatura. Un total de 1140 pacientes con NSCLC y 952 controles se incluyeron en los análisis de asociación. Nuestros datos revelaron niveles más altos de ARNm de SETDB1 en ADC (diferencia de medias estandarizada, DME: 0,88; intervalo de confianza del 95%, IC: 0,73–1,02; p <0,001) y SCC (DME: 0,40; IC del 95%: 0,13–0,66; p = 0,003) en comparación con los tejidos no cancerosos. Para los análisis clínico-patológicos, se incluyeron 2533 pacientes con ADC y 903 pacientes con SCC. Curiosamente, el nivel de ARNm de SETDB1 aumentó en los pacientes con NSCLC que eran fumadores actuales en comparación con los no fumadores (DME: 0,26; IC del 95%: 0,08 a 0,44; p = 0,004), y al comparar ex fumadores y no fumadores (p = 0,009) Además, el área bajo la curva (AUC) dada por la curva característica del operador del receptor resumen (sROC) fue 0.774 (Q = 0.713). Juntos, nuestros hallazgos sugieren una base sólida para futuras investigaciones para evaluar SETDB1 como un biomarcador de diagnóstico y / o su uso potencial como objetivo terapéutico en NSCLC.
Translated title of the contribution Expresión de la principal y pro-oncogénica H3K9 Lisina Metiltransferasa SETDB1 en cáncer de pulmón de células no pequeñas
Original languageEnglish
Article number1134
Pages (from-to)1-20
Number of pages20
JournalCancers
Volume11
Issue number8
DOIs
StatePublished - Aug 8 2019

All Science Journal Classification (ASJC) codes

  • Oncology
  • Cancer Research

Concepts

  • Concept

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